208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1236 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  52.36 
 
 		 194 aa  205  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  51.05 
 
 		 193 aa  197  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  53.16 
 
 		 186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  50.53 
 
 		 189 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  48.4 
 
 		 189 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  47.94 
 
 		 194 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  46.63 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  47 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  47.42 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  45.55 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  53.44 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  48.94 
 
 		 192 aa  158  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  45.88 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  43.16 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  47.06 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  38.5 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  40.5 
 
 		 188 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  44.68 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  39.27 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  35.45 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 		 190 aa  105  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  34.54 
 
 		 191 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 		 190 aa  101  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  34.85 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 		 197 aa  98.6  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  36.84 
 
 		 187 aa  98.6  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  36.56 
 
 		 188 aa  98.2  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  32.18 
 
 		 190 aa  96.7  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 		 188 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 		 192 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  34.05 
 
 		 183 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  35.42 
 
 		 372 aa  95.1  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  35.68 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  37.02 
 
 		 188 aa  91.7  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  37.04 
 
 		 186 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 		 187 aa  89.4  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  35.45 
 
 		 192 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 		 188 aa  88.6  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  34.59 
 
 		 350 aa  86.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 		 197 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  32.28 
 
 		 192 aa  85.9  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  35.48 
 
 		 186 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  44.74 
 
 		 113 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  37.1 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  32.96 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  29.74 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  26.98 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  27.13 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  30.21 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  31.34 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  27.53 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  27.96 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  29.23 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  26.88 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  27.93 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  30.81 
 
 		 194 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  38.71 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  38.3 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  28.33 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  30.6 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  31.03 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  31.03 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  31.03 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  31.03 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  29.5 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  29.5 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  29.5 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  29.5 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  29.5 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  29.5 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  29.5 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  27.32 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  28.75 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  28.33 
 
 		 183 aa  57  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  28.33 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  26.94 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  26.94 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  26.94 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  25.7 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>