232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6847 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  83.67 
 
 
197 aa  348  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  61.34 
 
 
197 aa  258  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  51.3 
 
 
199 aa  197  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  54.12 
 
 
192 aa  192  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  45.31 
 
 
190 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
186 aa  140  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  44.27 
 
 
190 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  39.58 
 
 
191 aa  134  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  36.41 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  39.01 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  38.86 
 
 
186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  41.33 
 
 
303 aa  127  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  39.01 
 
 
190 aa  123  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  42.62 
 
 
192 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  35.29 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  38 
 
 
192 aa  111  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
183 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  36.08 
 
 
201 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  35.68 
 
 
194 aa  101  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 
193 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 
187 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  35.23 
 
 
188 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  34.43 
 
 
183 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  33.51 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 
190 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  38.52 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 
190 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
197 aa  94.7  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  35.29 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  34.59 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  34.03 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  34.72 
 
 
197 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  32.16 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  32.89 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  34.72 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  29.63 
 
 
227 aa  85.9  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  32.33 
 
 
178 aa  84.7  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  31.61 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  32.45 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  33.59 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
372 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  27.92 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  32.45 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  34.71 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  28.35 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  36.88 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  36.88 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  25.26 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  38.32 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  37.12 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03840  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  37.12 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  28.22 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  29.45 
 
 
197 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  32.48 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  25.91 
 
 
196 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  32.48 
 
 
185 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  33.83 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  35.46 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  26.11 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  31.76 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  32.85 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  30.83 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  33.09 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  25.81 
 
 
306 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  30.07 
 
 
184 aa  58.2  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  33.08 
 
 
184 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  34.11 
 
 
182 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.58 
 
 
185 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  34.85 
 
 
184 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  32.33 
 
 
184 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  35.66 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  30.92 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  35.66 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  33.55 
 
 
185 aa  56.6  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  32.59 
 
 
183 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  32.59 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  28.95 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0985  NADPH-dependent FMN reductase  31.11 
 
 
202 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 
185 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>