More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1216 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 185 aa  386  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  69.02 
 
 		 186 aa  271  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  34.08 
 
 		 188 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  31.69 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  36.09 
 
 		 197 aa  90.9  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  29.51 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  31.79 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 		 190 aa  85.5  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 192 aa  85.1  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  29.71 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  35.53 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  31.22 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  27.68 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  30.91 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  26.34 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  27.93 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  28.18 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  28.22 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  26.82 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  34.09 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  33.08 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  31.39 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  25.57 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  34.09 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  32.81 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  27.37 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  30.71 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  25.75 
 
 		 216 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  29.52 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  31.79 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  28.48 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  26.51 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  26.51 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  25.86 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  27.75 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  29.59 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  25.84 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  25.39 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  27.72 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  29.92 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  24.64 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  29.09 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3574  hypothetical protein  32.62 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  26.06 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  26.4 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  26.34 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2123  NADPH-dependent FMN reductase  26.63 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  26.14 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  26.11 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03109  hypothetical protein  31.65 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  27.53 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  34.06 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2199  NADPH-dependent FMN reductase  26.47 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  26.11 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  25.88 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  29.83 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  33.93 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  27.03 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  33.03 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  25.81 
 
 		 192 aa  62  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3619  FMN reductase, NADPH-dependent  29.66 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  25.27 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  29.2 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3211  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.870894  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  32.48 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  32.76 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  31.01 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  26.09 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  27.85 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  26.63 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00441  putative reductase  35 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002868  hypothetical protein  32.81 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.277504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  25.67 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  24.87 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  32.47 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  27.7 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1148  NADPH-dependent FMN reductase  26.58 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>