157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002868 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002868  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.277504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03109  hypothetical protein  80.92 
 
 		 174 aa  288  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1695  hypothetical protein  73.41 
 
 		 175 aa  266  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.154497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3211  NADPH-dependent FMN reductase  64.74 
 
 		 173 aa  224  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.870894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3574  hypothetical protein  61.49 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1243  FMN reductase, NADPH-dependent  61.27 
 
 		 174 aa  213  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3754  NADPH-dependent FMN reductase  59.12 
 
 		 173 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2657  NADPH-dependent FMN reductase  56.07 
 
 		 171 aa  194  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489341 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3619  FMN reductase, NADPH-dependent  52.02 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1015  NADPH-dependent FMN reductase  57.23 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1037  hypothetical protein  63.64 
 
 		 132 aa  179  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0302  hypothetical protein  54.07 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2470  NADPH-dependent FMN reductase  52.35 
 
 		 174 aa  177  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.469467  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09863  hypothetical protein  37.34 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 180 aa  97.4  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  38.76 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  35.2 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  29.59 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  29.11 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  29.34 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  32.81 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  31.76 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  27.17 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  34.02 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  31.36 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  36.08 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  33.83 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  32.03 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  30.53 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1750  flavoprotein  30.49 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  30.83 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  36.59 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  25.41 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2123  NADPH-dependent FMN reductase  34.86 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  30.63 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  25.93 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1148  NADPH-dependent FMN reductase  26.95 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  31.14 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3292  NADPH-dependent FMN reductase  32.23 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.519739  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0477  NADPH-dependent FMN reductase  26.74 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307827  normal  0.877798 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  25.58 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.69 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  32.43 
 
 		 190 aa  52  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  30.08 
 
 		 192 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  27.64 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  29.67 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  27.61 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  28.65 
 
 		 184 aa  51.2  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 		 201 aa  51.2  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  29.84 
 
 		 180 aa  50.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  27.64 
 
 		 188 aa  50.8  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  30.83 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  29.73 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0090  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000795412  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0968  NADPH-dependent FMN reductase  31.9 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.150186  normal  0.201653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  25.88 
 
 		 185 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  32.18 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  31.67 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  30.86 
 
 		 188 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  30.86 
 
 		 188 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  30.86 
 
 		 188 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1202  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 182 aa  47.8  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  30.86 
 
 		 188 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  30.86 
 
 		 194 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  30.86 
 
 		 188 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  30.86 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  30.86 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  30.86 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  30.86 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6301  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 		 167 aa  47.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  30.86 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  30.86 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  30.86 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  30.86 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0413  hypothetical protein  27.5 
 
 		 267 aa  47.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000247794  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  28.46 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  35.16 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>