198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09863 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09863  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  411  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2470  NADPH-dependent FMN reductase  40.94 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.469467  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  41.11 
 
 		 180 aa  131  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03109  hypothetical protein  39.87 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2657  NADPH-dependent FMN reductase  37.21 
 
 		 171 aa  124  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489341 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1695  hypothetical protein  38.85 
 
 		 175 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.154497  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002868  hypothetical protein  37.34 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.277504  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3574  hypothetical protein  40.83 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0302  hypothetical protein  37.99 
 
 		 179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247279 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3754  NADPH-dependent FMN reductase  39.47 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3211  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.870894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3619  FMN reductase, NADPH-dependent  35.06 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1015  NADPH-dependent FMN reductase  39.07 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1243  FMN reductase, NADPH-dependent  37.42 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1037  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  33.1 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  31.74 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  31.07 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  34.15 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  28.41 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  37.21 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  25.99 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  29.66 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  32.88 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  30.6 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  37.97 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  37.97 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  37.97 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  27.01 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  31.93 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  27.01 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  27.01 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  27.01 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  27.01 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  27.01 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  27.01 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  34.35 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  27.01 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  34.11 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  30.63 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  27.01 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  31.09 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  34.11 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  27.47 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  34.75 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  29.24 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  30.58 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.3 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  27.71 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  29.75 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  28.37 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  30.5 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  27.44 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  31.88 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  27.87 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  32.2 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  34.45 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  35.59 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.54 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  27.59 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  30.34 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  32.82 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  33.61 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  32.82 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  32.82 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  32.82 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.62 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  26.09 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0154  NADPH-dependent FMN reductase  34.86 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.3 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  31.3 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.3 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  27.17 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  31.3 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0968  NADPH-dependent FMN reductase  29.86 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.150186  normal  0.201653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  23.12 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  33.08 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.3 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4080  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0440178  normal  0.0878712 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1750  flavoprotein  26.62 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.3 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.3 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.3 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  31.85 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  28.48 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3059  NADPH-dependent FMN reductase  32.19 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  25.56 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  27.21 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>