More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0432 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  86.01 
 
 		 193 aa  344  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  92.75 
 
 		 193 aa  343  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  83.77 
 
 		 212 aa  327  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  69.84 
 
 		 197 aa  270  8.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  65.1 
 
 		 192 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  43.62 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  43.72 
 
 		 189 aa  140  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  40.21 
 
 		 192 aa  125  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  44.44 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  36.46 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  42.27 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  41.18 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  38.5 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  44.17 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  42.62 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  37.82 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  39.13 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  35.98 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  38.92 
 
 		 185 aa  94.7  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 		 186 aa  94.4  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  40.71 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 173 aa  87.8  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  39.71 
 
 		 180 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  39.57 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  39.57 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  37.13 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  37.86 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  37.86 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  37.86 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  37.59 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  37.59 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  35.08 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  32.81 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  35.33 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0154  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  34.09 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  37.8 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  46.46 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  30.26 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  35.37 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  32.42 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  35.62 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.48 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.48 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.48 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.48 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.48 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.71 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.48 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  35.53 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  33.93 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.44 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  31.69 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  34.31 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  34.13 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36310  predicted flavoprotein  28.34 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  36.42 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  34.31 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34430  predicted flavoprotein  37.69 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.581519 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00481  putative reductase  25 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.543235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>