More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2887 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 190 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  43.23 
 
 		 195 aa  141  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  41.71 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  41.04 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  40.1 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  40.93 
 
 		 212 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  41.97 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  39.36 
 
 		 230 aa  121  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  41.45 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  43.55 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  41.08 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  43.29 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  41.04 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  39.69 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  42.02 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  42.78 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  44.17 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  39.25 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  37.77 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  44.17 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  37.56 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  38.74 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  36.07 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  36.07 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  35.71 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  36.9 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  36.9 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  36.9 
 
 		 188 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  36.9 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  35.98 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  35.23 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  32.42 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  37.2 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 		 189 aa  87.8  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  34.57 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  34.57 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  37.28 
 
 		 186 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 		 220 aa  85.9  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0154  NADPH-dependent FMN reductase  41.53 
 
 		 181 aa  85.1  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  35.33 
 
 		 185 aa  84.7  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  32.63 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.56 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  36.09 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  36.41 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  37.58 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  30.51 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  35.39 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  35.52 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  31.55 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  33.14 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  29.82 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  38.01 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  31.55 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  34.24 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  29.26 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  32.24 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  40.16 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  35.87 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  32.24 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  33.89 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  35.12 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  37.1 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  30.86 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  29.28 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  34.83 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.04 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>