More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0045 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
195 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  68.42 
 
 
194 aa  263  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  68.42 
 
 
194 aa  262  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  70.9 
 
 
193 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  63.87 
 
 
192 aa  246  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  64.25 
 
 
201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  45.73 
 
 
188 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 
189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  40.72 
 
 
193 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  45.71 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  38.02 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  42.27 
 
 
193 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  39.49 
 
 
212 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  42.69 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  35.83 
 
 
192 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  36.98 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  39.18 
 
 
193 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  40.12 
 
 
230 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  37.97 
 
 
197 aa  111  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  37.56 
 
 
190 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 
197 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  36.08 
 
 
184 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  36.08 
 
 
184 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  35.5 
 
 
216 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  35.23 
 
 
184 aa  94.7  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.72 
 
 
187 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  34.32 
 
 
186 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  34.32 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  36.46 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  35.16 
 
 
180 aa  89.4  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  34.32 
 
 
186 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
184 aa  88.2  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  37.65 
 
 
186 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  34.36 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  36.63 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  34.52 
 
 
185 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  37.43 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  36.53 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  36.08 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  36.99 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 
187 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  38.37 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  35.48 
 
 
184 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  35.93 
 
 
189 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  34.64 
 
 
186 aa  85.5  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  36.11 
 
 
183 aa  84.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  37.79 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  36.47 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  36.04 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  34.68 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  36.47 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  34.5 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  35.47 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  34.88 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  36.48 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  37.16 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  35.54 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  33.56 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  35.37 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 
203 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  35.93 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  38.12 
 
 
179 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  33.72 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  33.92 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  41.23 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  30.46 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  36.49 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  35.37 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  35.6 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  35.03 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.57 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2657  NADPH-dependent FMN reductase  34.12 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0489341 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  26.15 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.81 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.81 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.81 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.81 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  37.67 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  37.67 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00481  putative reductase  35.65 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.543235  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  37.24 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  34.1 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.81 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.81 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  35.81 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  35.57 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34430  predicted flavoprotein  39.55 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.581519 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  28.95 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  37.5 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  37.41 
 
 
184 aa  72  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>