261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0968 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0968  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
165 aa  330  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.150186  normal  0.201653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1652  NADPH-dependent FMN reductase  60 
 
 
180 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2187  NADPH-dependent FMN reductase  44.07 
 
 
179 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171107  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2518  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 
180 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.487931 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0672  hypothetical protein  38.85 
 
 
178 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.524204  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2219  NADPH-dependent FMN reductase  38.51 
 
 
177 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172404  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0477  NADPH-dependent FMN reductase  38.29 
 
 
181 aa  101  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307827  normal  0.877798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3059  NADPH-dependent FMN reductase  39.41 
 
 
183 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2763  NADPH-dependent FMN reductase  38.94 
 
 
181 aa  95.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4080  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
186 aa  90.9  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0440178  normal  0.0878712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0421  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 
177 aa  90.5  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  0.152802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3562  NADPH-dependent FMN reductase  40.56 
 
 
190 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0479753  normal  0.0938682 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2803  FMN reductase, NADPH-dependent  38.78 
 
 
180 aa  88.2  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.184131  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2429  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
180 aa  88.2  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00496276  hitchhiker  0.0000278376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6301  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3864  NADPH-dependent FMN reductase  39.86 
 
 
190 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5403  NADPH-dependent FMN reductase  39.86 
 
 
190 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
186 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  36.49 
 
 
189 aa  85.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4706  NADPH-dependent FMN reductase  39.16 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3657  NADPH-dependent FMN reductase  39.16 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164718  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  41.44 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  39.88 
 
 
185 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.44 
 
 
187 aa  79  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  36.42 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2452  NADPH-dependent FMN reductase  37.41 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  34.68 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  40.62 
 
 
185 aa  72  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  35.16 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  38.85 
 
 
184 aa  70.5  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  38.85 
 
 
184 aa  70.5  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4468  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  32.57 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1572  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4308  NADPH-dependent FMN reductase  43.48 
 
 
183 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  39.58 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  36.62 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  36.08 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  40.68 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  33.55 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  37.29 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3810  NADPH-dependent FMN reductase  32.57 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  36.08 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3425  hypothetical protein  48.57 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  36.03 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2039  NADPH-dependent FMN reductase  37.18 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.343608 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4019  NADPH-dependent FMN reductase  35.39 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  38.14 
 
 
188 aa  63.9  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  31.79 
 
 
190 aa  63.9  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  31.43 
 
 
189 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  36.03 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  33.53 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  34.06 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0100  hypothetical protein  32.31 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000132763  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34430  predicted flavoprotein  37.29 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.581519 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  36.17 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  38.54 
 
 
192 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  33.76 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  32.58 
 
 
189 aa  62.8  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  37.11 
 
 
194 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  35.51 
 
 
182 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
190 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  37.11 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  37.11 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  37.11 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  37.11 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
190 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  32.17 
 
 
187 aa  61.6  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 
186 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 
186 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  32.48 
 
 
188 aa  60.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1795  NADPH-dependent FMN reductase  36.91 
 
 
188 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709861  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1814  NADPH-dependent FMN reductase  36.91 
 
 
188 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.9444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1861  NADPH-dependent FMN reductase  36.91 
 
 
188 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.91747  normal  0.2434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
204 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3292  NADPH-dependent FMN reductase  35.77 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.519739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  32.19 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  31.97 
 
 
190 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  32.64 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  34.26 
 
 
188 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1202  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  38.95 
 
 
189 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  38.21 
 
 
185 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  33.88 
 
 
180 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
173 aa  58.2  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
188 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
188 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
188 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>