More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5403 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5403  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
190 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3562  NADPH-dependent FMN reductase  95.79 
 
 
190 aa  358  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0479753  normal  0.0938682 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3864  NADPH-dependent FMN reductase  88.89 
 
 
190 aa  331  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4706  NADPH-dependent FMN reductase  88.95 
 
 
190 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3657  NADPH-dependent FMN reductase  88.95 
 
 
190 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164718  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2452  NADPH-dependent FMN reductase  86.7 
 
 
190 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2803  FMN reductase, NADPH-dependent  53.22 
 
 
180 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.184131  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2429  NADPH-dependent FMN reductase  53.22 
 
 
180 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00496276  hitchhiker  0.0000278376 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3059  NADPH-dependent FMN reductase  38.55 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4080  NADPH-dependent FMN reductase  40.13 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0440178  normal  0.0878712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2518  NADPH-dependent FMN reductase  42.25 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.487931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2219  NADPH-dependent FMN reductase  41.72 
 
 
177 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172404  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0477  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
181 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307827  normal  0.877798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  40.71 
 
 
189 aa  101  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1652  NADPH-dependent FMN reductase  39.31 
 
 
180 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2763  NADPH-dependent FMN reductase  35.42 
 
 
181 aa  97.1  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  35.29 
 
 
184 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  47.79 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  32.2 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  43.28 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6301  NADPH-dependent FMN reductase  40.58 
 
 
167 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
187 aa  87  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4468  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
188 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0968  NADPH-dependent FMN reductase  39.86 
 
 
165 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.150186  normal  0.201653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.48 
 
 
187 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  31.65 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  31.37 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  31.37 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  31.37 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  31.37 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  31.37 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.44 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  36.43 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.42 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  29.87 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  33.15 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  40.31 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  37.33 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  29.3 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  44.68 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  36.09 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2187  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171107  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  32.45 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  37.5 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  28.66 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  28.66 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0672  hypothetical protein  26.44 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.524204  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  36.09 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  30.9 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.79 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.79 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.79 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.79 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  33.1 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  33.99 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  31.33 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  36.15 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1795  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709861  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1814  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.9444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  39.36 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1861  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.91747  normal  0.2434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  33.11 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  30.52 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  30.52 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  33.79 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2039  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.343608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4308  NADPH-dependent FMN reductase  32.2 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0421  NADPH-dependent FMN reductase  24.67 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  0.152802 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  44.57 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  41.3 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  36.96 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34430  predicted flavoprotein  34.27 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.581519 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  33.33 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  32.45 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  27.53 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3292  NADPH-dependent FMN reductase  39.02 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.519739  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  33.81 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  30.6 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1572  NADPH-dependent FMN reductase  29.31 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  34.1 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.13 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>