228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1652 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1652  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
180 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0968  NADPH-dependent FMN reductase  60 
 
 
165 aa  168  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.150186  normal  0.201653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4080  NADPH-dependent FMN reductase  42.94 
 
 
186 aa  134  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0440178  normal  0.0878712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2763  NADPH-dependent FMN reductase  38.55 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3059  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
183 aa  127  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3562  NADPH-dependent FMN reductase  40.46 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0479753  normal  0.0938682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0477  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 
181 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307827  normal  0.877798 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2429  NADPH-dependent FMN reductase  41.38 
 
 
180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00496276  hitchhiker  0.0000278376 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2803  FMN reductase, NADPH-dependent  41.38 
 
 
180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.184131  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3864  NADPH-dependent FMN reductase  38.73 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5403  NADPH-dependent FMN reductase  39.31 
 
 
190 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4706  NADPH-dependent FMN reductase  38.73 
 
 
190 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3657  NADPH-dependent FMN reductase  38.73 
 
 
190 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164718  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2452  NADPH-dependent FMN reductase  39.08 
 
 
190 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0672  hypothetical protein  33.73 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.524204  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2187  NADPH-dependent FMN reductase  31.52 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  35.81 
 
 
185 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  36.11 
 
 
184 aa  91.7  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2219  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
177 aa  90.9  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172404  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2518  NADPH-dependent FMN reductase  35.62 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.487931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6301  NADPH-dependent FMN reductase  37.31 
 
 
167 aa  88.6  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  34.66 
 
 
193 aa  84.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  35.97 
 
 
185 aa  84.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  33.94 
 
 
184 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0421  NADPH-dependent FMN reductase  29.7 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  0.152802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  34.13 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  33.73 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.62 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  32.96 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  31.9 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  33.95 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  34.66 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  33.8 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.73 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.73 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2039  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.343608 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.13 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  32.1 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34430  predicted flavoprotein  34.25 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.581519 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  32.52 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1572  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 
220 aa  74.3  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.12 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  32.76 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.12 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.12 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.12 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  32.1 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.29 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  31.33 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  33.14 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  31.9 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3810  NADPH-dependent FMN reductase  33.1 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  32.57 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  28.25 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3425  hypothetical protein  44.05 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  29.52 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  29.52 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  29.52 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  29.52 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4308  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  29.28 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  32.1 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  32.1 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  30.49 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  28.89 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  33.13 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4468  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4019  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1814  NADPH-dependent FMN reductase  32.21 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.9444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1861  NADPH-dependent FMN reductase  32.21 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.91747  normal  0.2434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  36.64 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1795  NADPH-dependent FMN reductase  32.21 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709861  normal  0.960554 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  28.8 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  31.29 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  28.8 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>