282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2803 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2429  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
180 aa  363  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00496276  hitchhiker  0.0000278376 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2803  FMN reductase, NADPH-dependent  100 
 
 
180 aa  363  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.184131  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3864  NADPH-dependent FMN reductase  53.22 
 
 
190 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4706  NADPH-dependent FMN reductase  53.45 
 
 
190 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3657  NADPH-dependent FMN reductase  53.45 
 
 
190 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164718  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5403  NADPH-dependent FMN reductase  53.22 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3562  NADPH-dependent FMN reductase  52.63 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0479753  normal  0.0938682 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2452  NADPH-dependent FMN reductase  54.39 
 
 
190 aa  164  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3059  NADPH-dependent FMN reductase  41.9 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4080  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0440178  normal  0.0878712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2219  NADPH-dependent FMN reductase  44.37 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172404  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0477  NADPH-dependent FMN reductase  41.14 
 
 
181 aa  124  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307827  normal  0.877798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2518  NADPH-dependent FMN reductase  41.55 
 
 
180 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.487931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1652  NADPH-dependent FMN reductase  41.38 
 
 
180 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2763  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 
181 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6301  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
167 aa  101  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0968  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.150186  normal  0.201653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  45.99 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0672  hypothetical protein  31.79 
 
 
178 aa  90.9  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.524204  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.97 
 
 
187 aa  89  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2187  NADPH-dependent FMN reductase  28.83 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171107  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  36.13 
 
 
187 aa  87.8  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4468  NADPH-dependent FMN reductase  36.61 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  31.52 
 
 
188 aa  84.3  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  34.86 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  31.52 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  31.52 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  31.52 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  31.52 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  31.52 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  37.59 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  35 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  35 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  40.18 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  36.88 
 
 
197 aa  79  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0421  NADPH-dependent FMN reductase  29.14 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  0.152802 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  29.35 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  29.35 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  39.29 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  35.48 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.37 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  28.74 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  41.11 
 
 
182 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  29.71 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  41.44 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  32.64 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  36.48 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0090  NADPH-dependent FMN reductase  31.48 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000795412  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1572  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  27.98 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  30.9 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  31.93 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.38 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  39.32 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  29.03 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  31.33 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  29.56 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  36.03 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  31.33 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  30.17 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.65 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  31.87 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  39.47 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  29.14 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  36.48 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4019  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  27.68 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.62 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.57 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>