202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0421 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0421  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
177 aa  361  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  0.152802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2187  NADPH-dependent FMN reductase  46.15 
 
 
179 aa  167  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171107  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0672  hypothetical protein  45.03 
 
 
178 aa  158  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.524204  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4080  NADPH-dependent FMN reductase  37.11 
 
 
186 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0440178  normal  0.0878712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0477  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 
181 aa  104  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307827  normal  0.877798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2763  NADPH-dependent FMN reductase  31.93 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0968  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 
165 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.150186  normal  0.201653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2219  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172404  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1652  NADPH-dependent FMN reductase  29.88 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3864  NADPH-dependent FMN reductase  25.47 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2429  NADPH-dependent FMN reductase  29.14 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00496276  hitchhiker  0.0000278376 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2803  FMN reductase, NADPH-dependent  29.14 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.184131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2518  NADPH-dependent FMN reductase  29.85 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.487931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4706  NADPH-dependent FMN reductase  24.84 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3657  NADPH-dependent FMN reductase  24.84 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164718  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3059  NADPH-dependent FMN reductase  27.63 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3562  NADPH-dependent FMN reductase  25.33 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0479753  normal  0.0938682 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  30.95 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5403  NADPH-dependent FMN reductase  24.67 
 
 
190 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  31.64 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  28.4 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  29.68 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  28.3 
 
 
183 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  29.76 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  29.76 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1750  flavoprotein  28.57 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117667  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  29.76 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  29.76 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  29.76 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  26.11 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  31.69 
 
 
203 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  28.33 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  28.57 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  31.01 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  28.57 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  26.78 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2452  NADPH-dependent FMN reductase  24 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6301  NADPH-dependent FMN reductase  30.23 
 
 
167 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 
184 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 
184 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 
184 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
188 aa  62.4  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.98 
 
 
185 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  31.39 
 
 
181 aa  61.6  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.98 
 
 
185 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  27.98 
 
 
185 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 
186 aa  61.6  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  28.82 
 
 
187 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.98 
 
 
185 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.98 
 
 
185 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.98 
 
 
185 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  31.93 
 
 
187 aa  60.8  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.98 
 
 
185 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  27.81 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  30.71 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  29.78 
 
 
186 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  27.65 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  27.81 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  31.71 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  27.65 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1444  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.61 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  27.65 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1749  flavoprotein  29.07 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000367939  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1082  hypothetical protein  29.78 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137626  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  34.07 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  34.07 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  30.83 
 
 
220 aa  58.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  27.65 
 
 
184 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  27.06 
 
 
184 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  27.22 
 
 
184 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  27.88 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.98 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  29.34 
 
 
416 aa  57  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.61 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  25.28 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  29.71 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  22.01 
 
 
189 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  40.22 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  33.93 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0262  NADPH-dependent FMN reductase  26.35 
 
 
403 aa  55.5  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33413  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  27.07 
 
 
185 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  32.74 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 
186 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 
182 aa  54.3  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  27.71 
 
 
183 aa  54.3  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>