256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0672 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0672  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  368  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.524204  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2187  NADPH-dependent FMN reductase  55.88 
 
 
179 aa  200  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171107  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0421  NADPH-dependent FMN reductase  45.03 
 
 
177 aa  158  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  0.152802 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2763  NADPH-dependent FMN reductase  39.08 
 
 
181 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4080  NADPH-dependent FMN reductase  41.81 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0440178  normal  0.0878712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0477  NADPH-dependent FMN reductase  32.16 
 
 
181 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307827  normal  0.877798 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2219  NADPH-dependent FMN reductase  35.84 
 
 
177 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172404  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3059  NADPH-dependent FMN reductase  40.48 
 
 
183 aa  104  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0968  NADPH-dependent FMN reductase  38.85 
 
 
165 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.150186  normal  0.201653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6301  NADPH-dependent FMN reductase  34.88 
 
 
167 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2518  NADPH-dependent FMN reductase  33.14 
 
 
180 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.487931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  32.02 
 
 
189 aa  94.4  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  30.17 
 
 
186 aa  92.8  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2803  FMN reductase, NADPH-dependent  31.79 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.184131  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2429  NADPH-dependent FMN reductase  31.79 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00496276  hitchhiker  0.0000278376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1652  NADPH-dependent FMN reductase  33.73 
 
 
180 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  28.89 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  31.06 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1749  flavoprotein  34.78 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000367939  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  29.35 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  29.35 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3562  NADPH-dependent FMN reductase  26.7 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0479753  normal  0.0938682 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3864  NADPH-dependent FMN reductase  27.01 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  29.71 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  27.42 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4706  NADPH-dependent FMN reductase  27.33 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3657  NADPH-dependent FMN reductase  27.33 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164718  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5403  NADPH-dependent FMN reductase  26.44 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  26.49 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  26.49 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  28.16 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  34.09 
 
 
197 aa  74.3  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  29.07 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  31.71 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  27.03 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  27.03 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  27.53 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  27.03 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  31.14 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  27.03 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.7 
 
 
187 aa  72  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  27.03 
 
 
194 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2452  NADPH-dependent FMN reductase  31.1 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  33.86 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  27.78 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  26.34 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.89 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  36.56 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  28.89 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0100  hypothetical protein  33.68 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000132763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.89 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.78 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.78 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.78 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.78 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.33 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  27.87 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
185 aa  67.4  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
182 aa  67.4  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 
190 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 
190 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  31.17 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  31.72 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  28.74 
 
 
416 aa  65.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  25.14 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  25.14 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  25.14 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  25.99 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  26.86 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  27.01 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1202  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4308  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  25.28 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  26.52 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  27.01 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  27.01 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>