197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3619 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3619  FMN reductase, NADPH-dependent  100 
 
 		 177 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3574  hypothetical protein  64.74 
 
 		 177 aa  228  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3211  NADPH-dependent FMN reductase  64.74 
 
 		 173 aa  227  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.870894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3754  NADPH-dependent FMN reductase  66.04 
 
 		 173 aa  224  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1243  FMN reductase, NADPH-dependent  61.49 
 
 		 174 aa  218  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03109  hypothetical protein  54.6 
 
 		 174 aa  206  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1015  NADPH-dependent FMN reductase  56.07 
 
 		 173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0302  hypothetical protein  55.68 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247279 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002868  hypothetical protein  52.02 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.277504  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1695  hypothetical protein  45.98 
 
 		 175 aa  177  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.154497  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2470  NADPH-dependent FMN reductase  46.47 
 
 		 174 aa  175  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.469467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2657  NADPH-dependent FMN reductase  49.09 
 
 		 171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489341 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1037  hypothetical protein  59.09 
 
 		 132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09863  hypothetical protein  35.06 
 
 		 202 aa  114  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  33.91 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  35.66 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  34.4 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  29.51 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.29 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  33.62 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  31.74 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  32.81 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  31.09 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1082  hypothetical protein  33.61 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  33.33 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  34.17 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  32.52 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 		 184 aa  62  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  29.66 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  26.51 
 
 		 188 aa  62  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  26.99 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  32.06 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  28.46 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  30.33 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  33.88 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  32.52 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  30.95 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  26.7 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  29.23 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  27.82 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  28.45 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  23.89 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  23.89 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  23.89 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  23.89 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  23.89 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  23.89 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  23.89 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  23.89 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  23.89 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  27.43 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  29.71 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.87 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  34.88 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  26.25 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.86 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  27.07 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  34.83 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  27.71 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  26.47 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  27.71 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  26.47 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0413  hypothetical protein  27.59 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000247794  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  26.47 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  26.47 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  26.47 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  25.19 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  29.75 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  32.91 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  26.25 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  28.31 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  28.7 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2219  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  27.48 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>