280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03220 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  100 
 
 
187 aa  384  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  74.18 
 
 
192 aa  280  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  63.04 
 
 
197 aa  246  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  63.24 
 
 
186 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  60.33 
 
 
190 aa  240  9e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  58.92 
 
 
191 aa  231  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  56.22 
 
 
183 aa  208  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  50 
 
 
209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  44.69 
 
 
192 aa  157  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
199 aa  154  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  47.72 
 
 
201 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  44.57 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
197 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  38.86 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  42.16 
 
 
190 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  60.38 
 
 
113 aa  134  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 
188 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  39.04 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  38.02 
 
 
197 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  36.02 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  36.41 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  38.59 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  35.87 
 
 
195 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  42.65 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  36.56 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  42.56 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  41.62 
 
 
350 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  49.32 
 
 
197 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  39.15 
 
 
372 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 
187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  40.86 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
193 aa  111  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  36.36 
 
 
189 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  49.14 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  39.56 
 
 
194 aa  108  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  40.1 
 
 
190 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  39.06 
 
 
190 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  34.39 
 
 
198 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 
190 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
188 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  38.86 
 
 
214 aa  101  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  36.41 
 
 
197 aa  101  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  36.36 
 
 
202 aa  100  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  39.44 
 
 
186 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  39.11 
 
 
205 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  40.64 
 
 
230 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
303 aa  99.4  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  36.84 
 
 
227 aa  98.6  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  40.64 
 
 
205 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03840  conserved hypothetical protein  33.75 
 
 
213 aa  88.6  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  41.35 
 
 
188 aa  88.6  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  36.15 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  40.61 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  34.59 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  30.27 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  27.93 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  31.84 
 
 
196 aa  72  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  31.32 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  33.79 
 
 
183 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  33.82 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  32.53 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  30.95 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  31.49 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  35.25 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  31.49 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  34.09 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  31.43 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  31.43 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  33.55 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  37.31 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  29.84 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2733  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 
174 aa  62  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  34.73 
 
 
184 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  28.27 
 
 
196 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 
188 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  29.27 
 
 
197 aa  61.2  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  34 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  30.77 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  28.96 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  29.12 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  25.81 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  28.02 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>