253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2060 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  100 
 
 
191 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  65.41 
 
 
186 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  62.03 
 
 
190 aa  250  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  61.29 
 
 
192 aa  238  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  58.92 
 
 
187 aa  231  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  58.92 
 
 
183 aa  223  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  55 
 
 
209 aa  221  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  56.68 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  51.04 
 
 
201 aa  164  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  70.27 
 
 
113 aa  161  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  42.78 
 
 
192 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  43.09 
 
 
199 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  44.97 
 
 
197 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  43.48 
 
 
190 aa  140  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  38.71 
 
 
188 aa  135  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  39.58 
 
 
197 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  36.22 
 
 
187 aa  131  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  38.66 
 
 
195 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  37.36 
 
 
183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  36.7 
 
 
192 aa  124  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  39.38 
 
 
197 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  43.39 
 
 
192 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  38.17 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  37.58 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  38.3 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  34.95 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  39.78 
 
 
187 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  45.89 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  38.8 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  43.92 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  39.01 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  38.22 
 
 
214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  37.97 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 
372 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  38.17 
 
 
350 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  39.18 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  39.15 
 
 
189 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  34.83 
 
 
180 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  34.54 
 
 
227 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
186 aa  101  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 
190 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
190 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 
193 aa  94.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  35.98 
 
 
188 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  43.84 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
303 aa  92.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  35.35 
 
 
230 aa  90.9  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  34.85 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  36.76 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  35.05 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  37.64 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  31.39 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03840  conserved hypothetical protein  28.12 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  37.24 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  34.97 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  35.62 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  35.62 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  34.93 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  32.51 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  34.04 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  31.09 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  33.1 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  33.1 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  33.1 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  32.41 
 
 
306 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  32.89 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  28.93 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  33.56 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  31.41 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  36.5 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  33.97 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
185 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 
183 aa  62  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  31.4 
 
 
197 aa  61.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  32.73 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  32.17 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  32.21 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  32.47 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>