163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2517 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  78.57 
 
 		 306 aa  327  8e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  76.53 
 
 		 196 aa  305  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  75.51 
 
 		 196 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  68.37 
 
 		 196 aa  275  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  49.74 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  48.45 
 
 		 192 aa  184  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  49.48 
 
 		 192 aa  184  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  48.45 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  33.66 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  34.75 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  32.3 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  31.31 
 
 		 289 aa  81.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  31.22 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  30.69 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  29.84 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  25.65 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  26.98 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  30.07 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  31.22 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  30.21 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  27.84 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  27.23 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  29.79 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0308  flavoprotein  35.19 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21882  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  27.32 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  28.65 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  30.19 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  29.53 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  27.46 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  29.89 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  32.65 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  29.15 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  28.72 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  31.87 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  28.86 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  25.13 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  28.27 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  29.14 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  27.08 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  25.77 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  30.72 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  24.21 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  30.12 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  25.5 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  29.22 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  27.8 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  28.9 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  28.88 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  27.7 
 
 		 350 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  28.43 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  27.08 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  26.86 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  25.53 
 
 		 181 aa  51.6  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  29.84 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  30.32 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  28.27 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  32.41 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  27.82 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  27.66 
 
 		 303 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  33.13 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  26.4 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  40.28 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  40.28 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  40.28 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  40.28 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  40.28 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  25.82 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  27.56 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  25.56 
 
 		 180 aa  48.1  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1444  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.73 
 
 		 181 aa  48.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  34.17 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  27.16 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  37.97 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>