248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4938 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
194 aa  390  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  55.38 
 
 
187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  45.74 
 
 
194 aa  177  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  47.94 
 
 
227 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  44.68 
 
 
193 aa  165  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  47.59 
 
 
189 aa  164  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  46.49 
 
 
190 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  47.62 
 
 
202 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  47.78 
 
 
189 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  46.43 
 
 
230 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  45.6 
 
 
197 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  46.24 
 
 
186 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  41.97 
 
 
197 aa  144  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  49.45 
 
 
205 aa  141  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  43.32 
 
 
214 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  41.85 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  45.21 
 
 
205 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  41.62 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  38.3 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  44.63 
 
 
178 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  40.34 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  40.76 
 
 
183 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  38.8 
 
 
190 aa  117  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  39.01 
 
 
186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  39.56 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  39.13 
 
 
191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  36.61 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  37.11 
 
 
209 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  39.13 
 
 
192 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  37.63 
 
 
197 aa  105  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
195 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
199 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  35.96 
 
 
190 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  39.11 
 
 
188 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 
188 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 
197 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  35.98 
 
 
197 aa  99  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  34.59 
 
 
197 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  38.27 
 
 
183 aa  97.8  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  31.69 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  35.84 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  34.22 
 
 
192 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  39.13 
 
 
190 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  36.6 
 
 
190 aa  91.3  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  26.49 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  41.86 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 
372 aa  90.1  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  36.96 
 
 
186 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  37.7 
 
 
190 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 
350 aa  84.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  28.9 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  46.3 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  33.61 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  27.03 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  28.09 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  34.82 
 
 
188 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  28.96 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  31.38 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  28.43 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  33.09 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  25.14 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2123  NADPH-dependent FMN reductase  32.33 
 
 
195 aa  61.6  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  26.6 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  25.14 
 
 
306 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  27.21 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  33.81 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  33.09 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0206  azoreductase  28.17 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  29.5 
 
 
190 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  29.5 
 
 
190 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  27.93 
 
 
196 aa  58.2  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03840  conserved hypothetical protein  27.34 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  35.04 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  30.94 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.52 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  32.05 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  31.33 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  28.67 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  35 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  31.29 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  29.24 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  32.32 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  31.43 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  29.21 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.22 
 
 
185 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.22 
 
 
185 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 
185 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  28.11 
 
 
184 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  28.11 
 
 
184 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  28.11 
 
 
184 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  32.47 
 
 
184 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>