231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2378 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  97.92 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  95.31 
 
 		 192 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  77.08 
 
 		 192 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  76.04 
 
 		 192 aa  297  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  46.6 
 
 		 188 aa  188  5e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  49.74 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  49.23 
 
 		 306 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  48.68 
 
 		 196 aa  177  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  48.09 
 
 		 196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  45.79 
 
 		 196 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  36.99 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  37.34 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  39.08 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  34.04 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  31.13 
 
 		 289 aa  89.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  29.44 
 
 		 186 aa  88.6  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  33.87 
 
 		 190 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  31.38 
 
 		 190 aa  87.8  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  32.09 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  33.87 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0308  flavoprotein  40.2 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21882  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  31.41 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  31.35 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  37.29 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  31.03 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  30.43 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  32.45 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  29.79 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 		 230 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  33.78 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  35.43 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  27.89 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  31.38 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  31.44 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  27.96 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  35.51 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  30.1 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  31.75 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  34.85 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  33 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  32.52 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  32.52 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  28.04 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  27.08 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  32.04 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  26.57 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  28.35 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  31.52 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  28.02 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  32.12 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  27.17 
 
 		 350 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  27.17 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  28.22 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  25.77 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  25.77 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  25.77 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  27.37 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  29.7 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  28.67 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  27.37 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  25.77 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  25.77 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  25.77 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  32.37 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  25.77 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  25.77 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  30.16 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  29.66 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  32.39 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  27.97 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  24.74 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  31.47 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  25.15 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  27.75 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  26.23 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>