217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2088 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
195 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  65.78 
 
 
187 aa  277  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  57.75 
 
 
188 aa  233  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  58.2 
 
 
188 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  48.65 
 
 
190 aa  187  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  46.49 
 
 
192 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  45.9 
 
 
188 aa  175  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  41.85 
 
 
190 aa  170  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  41.08 
 
 
190 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  43.17 
 
 
350 aa  157  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  41.94 
 
 
190 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  41.88 
 
 
372 aa  155  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  39.46 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  38.66 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  35.12 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  37.1 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  35.87 
 
 
187 aa  129  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  40.45 
 
 
188 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 
192 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  37.31 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  33.86 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  36.46 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  34.92 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
193 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  35.45 
 
 
227 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  35.57 
 
 
201 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  36.3 
 
 
178 aa  108  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 
197 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  35.98 
 
 
186 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  35.98 
 
 
187 aa  104  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
194 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 
203 aa  101  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  37.25 
 
 
202 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
189 aa  98.2  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 
230 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
198 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
197 aa  94.7  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
178 aa  92.8  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 
192 aa  92  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  31.41 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  31.05 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 
205 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  32.45 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  38.02 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  32.86 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  30.32 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  29.23 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  32.58 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03840  conserved hypothetical protein  28.33 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  28.72 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  29.84 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
190 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  32.26 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  25.77 
 
 
196 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  40.23 
 
 
188 aa  61.2  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  27.08 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  24.87 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  27.7 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  25.17 
 
 
196 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  27.42 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.29 
 
 
181 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  26.15 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  24.49 
 
 
306 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  26.56 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0985  NADPH-dependent FMN reductase  26.29 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  26.56 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  26.56 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  25.52 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  33.55 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  30.17 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  30.7 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  30.7 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  30.17 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  30.17 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  28 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  31.93 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  30.7 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  30.7 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  25.52 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  30.7 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  25.95 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  30.7 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  30.14 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  31.54 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  23.39 
 
 
196 aa  52.4  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  35.96 
 
 
186 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>