95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0985 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0985  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
202 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1997  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 
198 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.88361  normal  0.0341206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1017  NADPH-dependent FMN reductase  41.71 
 
 
204 aa  154  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1047  NADPH-dependent FMN reductase  39.72 
 
 
210 aa  152  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.418607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1112  NADPH-dependent FMN reductase  39.34 
 
 
204 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0887  NADPH-dependent FMN reductase  39.61 
 
 
202 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1079  NADPH-dependent FMN reductase  39.34 
 
 
204 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1010  NADPH-dependent FMN reductase  39.34 
 
 
204 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3279  NADPH-dependent FMN reductase  39.34 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.097942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0914  NADPH-dependent FMN reductase  40.58 
 
 
201 aa  145  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3585  azoreductase, putative  36.02 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3177  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3080  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0693742  normal  0.504641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2999  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930809  normal  0.251382 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0067  putative oxidoreductase  40.5 
 
 
192 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0994  NADPH-dependent FMN reductase  36.16 
 
 
218 aa  135  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0090  hypothetical protein  34.11 
 
 
210 aa  131  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2787  azoreductase, putative  36.73 
 
 
194 aa  111  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  32.58 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  29.55 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  32.84 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  31.54 
 
 
188 aa  58.9  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  28.67 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  26.29 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  28 
 
 
178 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  28 
 
 
178 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  28 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  28 
 
 
179 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  25.52 
 
 
199 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  27.33 
 
 
178 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  31.11 
 
 
197 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  28 
 
 
178 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  28 
 
 
178 aa  55.1  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  22.49 
 
 
190 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  32.33 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  32.03 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  27.23 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  27.04 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  26.49 
 
 
178 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  32.85 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  27.33 
 
 
178 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3533  NADPH-dependent FMN reductase  29.75 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  31.82 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  27.33 
 
 
178 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  26.89 
 
 
187 aa  52  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 
350 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  31.06 
 
 
190 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  30.23 
 
 
192 aa  52  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  25.53 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  26.15 
 
 
187 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  29.13 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2733  NADPH-dependent FMN reductase  30.25 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  29.13 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  26.45 
 
 
185 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  25.64 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  28 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  25.64 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  27.41 
 
 
188 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
193 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  29.46 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  25.26 
 
 
186 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  30.08 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  26.5 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 
192 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  27.36 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  24.75 
 
 
230 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 
197 aa  45.1  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  26.7 
 
 
181 aa  45.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  29.63 
 
 
197 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
197 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 
192 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  29.55 
 
 
188 aa  44.7  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  29.55 
 
 
188 aa  44.7  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  32.06 
 
 
192 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0206  azoreductase  28.79 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  29.63 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  26.02 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  25.21 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  29.06 
 
 
306 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  31.31 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  32.18 
 
 
372 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  28.23 
 
 
223 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  27.56 
 
 
178 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  24.6 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3483  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 
161 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
180 aa  42.4  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  26.23 
 
 
190 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  29.82 
 
 
196 aa  42  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  24.81 
 
 
197 aa  41.6  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
194 aa  41.6  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>