127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3483 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3483  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2733  NADPH-dependent FMN reductase  46.88 
 
 
174 aa  156  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1389  hypothetical protein  45.96 
 
 
178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3533  NADPH-dependent FMN reductase  39.24 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  30.06 
 
 
195 aa  77  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  41.98 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  41.98 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  36 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  37.61 
 
 
184 aa  63.9  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  39.76 
 
 
184 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  39.76 
 
 
184 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  39.76 
 
 
184 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 
184 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  39.76 
 
 
184 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.55 
 
 
185 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
185 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
185 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  40.51 
 
 
185 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  32.54 
 
 
187 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  40.24 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  34.26 
 
 
182 aa  58.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  30.95 
 
 
182 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 
183 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 
183 aa  57.4  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  36.14 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  34.52 
 
 
183 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  34.52 
 
 
183 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 
183 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  31.09 
 
 
183 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  26.06 
 
 
184 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
183 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  34.52 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 
184 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  30.85 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  34.12 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  33.73 
 
 
183 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  35.06 
 
 
183 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  37.18 
 
 
203 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 
193 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  37.33 
 
 
190 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  34.02 
 
 
183 aa  50.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  36.99 
 
 
190 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  39.13 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  35 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
206 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  36.14 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  36.99 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  35.8 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  39.73 
 
 
189 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1726  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
280 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  35.29 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  31.76 
 
 
184 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 
182 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
186 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
186 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  31.76 
 
 
184 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 
187 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 
185 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  32.52 
 
 
186 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  33.67 
 
 
227 aa  47.8  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 
214 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  38.36 
 
 
204 aa  47.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  28.35 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 
185 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  34.74 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  28.35 
 
 
186 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
184 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.15 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  29.21 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  24.62 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  29.7 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  31.48 
 
 
194 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  31.4 
 
 
187 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  31.9 
 
 
194 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
189 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  28.23 
 
 
195 aa  44.7  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  27.1 
 
 
192 aa  44.3  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  28.69 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  32.94 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  33.72 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  29.82 
 
 
201 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  34.18 
 
 
192 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  29.37 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  28.47 
 
 
188 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  31.71 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  28.89 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  39.73 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  28.23 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>