224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3533 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3533  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
173 aa  356  8e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2733  NADPH-dependent FMN reductase  42.67 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3483  NADPH-dependent FMN reductase  39.24 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1389  hypothetical protein  37.93 
 
 
178 aa  108  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  25.9 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  32.39 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  28.98 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  30.32 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  32.35 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  23.98 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  27.84 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  31.07 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  27.53 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  28.41 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  28.32 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  26.78 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  30.29 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  28.48 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 
186 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  26.7 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.59 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  29.48 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
186 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  26.7 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  30.29 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  29.14 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  28.41 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.76 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.76 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.76 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.76 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.76 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  32.76 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.76 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 
182 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.76 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  26.7 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  32.76 
 
 
183 aa  62  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  28.98 
 
 
184 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  28.41 
 
 
184 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  31.62 
 
 
184 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  26.97 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  29.78 
 
 
187 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  30.13 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
184 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
184 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  31.86 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
184 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  28.98 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  29.91 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  27.53 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  26.26 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  28.98 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.81 
 
 
187 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  29.3 
 
 
189 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  27.27 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  26.88 
 
 
203 aa  58.2  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  26.51 
 
 
189 aa  58.2  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
184 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  28.14 
 
 
187 aa  57.8  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  26.96 
 
 
192 aa  57.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2123  NADPH-dependent FMN reductase  26.57 
 
 
195 aa  57.8  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  26.7 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  23.76 
 
 
197 aa  57  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
206 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  27.83 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  27.83 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  26.7 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3750  NADPH-dependent FMN reductase  26.95 
 
 
199 aa  55.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  28.77 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  28.3 
 
 
227 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  25.99 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  22.6 
 
 
186 aa  55.1  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  24.84 
 
 
192 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  25.42 
 
 
186 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  28.08 
 
 
186 aa  54.3  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  30.28 
 
 
180 aa  54.3  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  29.8 
 
 
189 aa  54.3  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  28.16 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  24.86 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  33.73 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  24.42 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  26.82 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  24.53 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 
214 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  30.83 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0985  NADPH-dependent FMN reductase  29.75 
 
 
202 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  28.48 
 
 
185 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  24 
 
 
192 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  25.99 
 
 
230 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  22.7 
 
 
194 aa  52  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>