88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3585 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3585  azoreductase, putative  100 
 
 		 204 aa  428  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3177  NADPH-dependent FMN reductase  91.18 
 
 		 204 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3080  NADPH-dependent FMN reductase  91.18 
 
 		 204 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0693742  normal  0.504641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2999  NADPH-dependent FMN reductase  91.18 
 
 		 204 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930809  normal  0.251382 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1112  NADPH-dependent FMN reductase  82.35 
 
 		 204 aa  362  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1079  NADPH-dependent FMN reductase  81.37 
 
 		 204 aa  358  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1010  NADPH-dependent FMN reductase  81.37 
 
 		 204 aa  357  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3279  NADPH-dependent FMN reductase  80.88 
 
 		 204 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.097942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1017  NADPH-dependent FMN reductase  77.94 
 
 		 204 aa  349  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0887  NADPH-dependent FMN reductase  65.38 
 
 		 202 aa  280  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0994  NADPH-dependent FMN reductase  61.16 
 
 		 218 aa  274  8e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0914  NADPH-dependent FMN reductase  64.73 
 
 		 201 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1047  NADPH-dependent FMN reductase  64.35 
 
 		 210 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.418607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0090  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  207  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2787  azoreductase, putative  43.98 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0985  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1997  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.88361  normal  0.0341206 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0067  putative oxidoreductase  36.41 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  31.16 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  29.69 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  32.23 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  31.17 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1954  NADPH-dependent FMN reductase  28.67 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.867559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  33.06 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  32.23 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  32.23 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  32.23 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  28.39 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  32.23 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  32.23 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  32.23 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  31.4 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 		 372 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  31.4 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  29.01 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  34.4 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 		 182 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  30.77 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  30.77 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2123  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1148  NADPH-dependent FMN reductase  28.68 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  28.46 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  26.35 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  29.6 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3750  NADPH-dependent FMN reductase  26.63 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  26.77 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  26.28 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  31.4 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  27.33 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  25.52 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  29.27 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  24.35 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  29.27 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  35.48 
 
 		 180 aa  46.2  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  32.03 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  25.95 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  27.56 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 		 350 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  27.16 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  25.71 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2518  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.487931 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  27.56 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  27.56 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5993  hypothetical protein  40.74 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  27.56 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  27.56 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  27.56 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  27.56 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  27.56 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2656  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 179 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  25.37 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  25.5 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  29.69 
 
 		 185 aa  42  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  25.81 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  28.91 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 		 185 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>