32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5993 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5993  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7142  hypothetical protein  90.15 
 
 
205 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0417  NADPH-dependent FMN reductase  68.34 
 
 
205 aa  288  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4291  hypothetical protein  66.5 
 
 
210 aa  285  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4745  hypothetical protein  51.74 
 
 
206 aa  209  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2527  hypothetical protein  50.99 
 
 
209 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2572  hypothetical protein  50.99 
 
 
209 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1969  hypothetical protein  52.76 
 
 
207 aa  191  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256176  normal  0.256404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2564  hypothetical protein  50.99 
 
 
209 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3624  hypothetical protein  56.22 
 
 
205 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4331  manganese transport protein  49.49 
 
 
201 aa  170  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4864  hypothetical protein  50.97 
 
 
201 aa  168  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588631  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0810  BRAMP  40.8 
 
 
233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.22904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2077  BRAMP  41.75 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00766184  normal  0.590504 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2691  hypothetical protein  39.41 
 
 
234 aa  143  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1423  hypothetical protein  38.31 
 
 
248 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10403  hypothetical protein  34.3 
 
 
236 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10943  hypothetical protein  35.12 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2466  hypothetical protein  34.72 
 
 
243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00315756  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3009  hypothetical protein  32.84 
 
 
249 aa  111  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2720  hypothetical protein  32.85 
 
 
240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00344324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1830  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  29.14 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00348996  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  24.27 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.72 
 
 
374 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  27.13 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  27.13 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3177  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3080  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0693742  normal  0.504641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2999  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930809  normal  0.251382 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3585  azoreductase, putative  40.74 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  24.5 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  27.96 
 
 
187 aa  41.6  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>