59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1047 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1047  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
210 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.418607  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0994  NADPH-dependent FMN reductase  72.48 
 
 
218 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0887  NADPH-dependent FMN reductase  69.52 
 
 
202 aa  298  5e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0914  NADPH-dependent FMN reductase  67.62 
 
 
201 aa  286  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3585  azoreductase, putative  64.35 
 
 
204 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3080  NADPH-dependent FMN reductase  62.5 
 
 
204 aa  271  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0693742  normal  0.504641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2999  NADPH-dependent FMN reductase  62.5 
 
 
204 aa  271  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930809  normal  0.251382 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3177  NADPH-dependent FMN reductase  62.04 
 
 
204 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1112  NADPH-dependent FMN reductase  60.19 
 
 
204 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1079  NADPH-dependent FMN reductase  59.72 
 
 
204 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1017  NADPH-dependent FMN reductase  60.19 
 
 
204 aa  258  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1010  NADPH-dependent FMN reductase  59.72 
 
 
204 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3279  NADPH-dependent FMN reductase  59.72 
 
 
204 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.097942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0090  hypothetical protein  58.1 
 
 
210 aa  251  7e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0985  NADPH-dependent FMN reductase  39.72 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2787  azoreductase, putative  44.27 
 
 
194 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1997  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
198 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.88361  normal  0.0341206 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0067  putative oxidoreductase  32.29 
 
 
192 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  29.63 
 
 
178 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  30.37 
 
 
178 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  30.37 
 
 
178 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  31.85 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  31.85 
 
 
178 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  31.85 
 
 
178 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  29.63 
 
 
179 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  28.1 
 
 
176 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  33.06 
 
 
178 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  29.63 
 
 
178 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  33.06 
 
 
178 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  29.63 
 
 
178 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  29.63 
 
 
178 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  29.63 
 
 
178 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 
195 aa  52  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  37.23 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3750  NADPH-dependent FMN reductase  24.32 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  29.84 
 
 
182 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1954  NADPH-dependent FMN reductase  24.32 
 
 
197 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.867559  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  23.26 
 
 
186 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  29.91 
 
 
181 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  30.19 
 
 
183 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 
192 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 
197 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  31.4 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  26.13 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  24.38 
 
 
188 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  29.07 
 
 
185 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  23.57 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1148  NADPH-dependent FMN reductase  27.74 
 
 
183 aa  42.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148322  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  25.62 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  29.63 
 
 
188 aa  42.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  29.63 
 
 
188 aa  42.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  24.79 
 
 
186 aa  42  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 
207 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 
207 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  24.79 
 
 
186 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4745  hypothetical protein  34.18 
 
 
206 aa  41.6  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>