81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2787 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2787  azoreductase, putative  100 
 
 
194 aa  396  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0914  NADPH-dependent FMN reductase  45.59 
 
 
201 aa  175  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1112  NADPH-dependent FMN reductase  45.55 
 
 
204 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1079  NADPH-dependent FMN reductase  45.03 
 
 
204 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3585  azoreductase, putative  43.98 
 
 
204 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1010  NADPH-dependent FMN reductase  44.5 
 
 
204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3279  NADPH-dependent FMN reductase  44.5 
 
 
204 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.097942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3177  NADPH-dependent FMN reductase  45.55 
 
 
204 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3080  NADPH-dependent FMN reductase  45.03 
 
 
204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0693742  normal  0.504641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2999  NADPH-dependent FMN reductase  45.03 
 
 
204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930809  normal  0.251382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1017  NADPH-dependent FMN reductase  43.98 
 
 
204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0090  hypothetical protein  42.38 
 
 
210 aa  160  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1047  NADPH-dependent FMN reductase  44.27 
 
 
210 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.418607  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0994  NADPH-dependent FMN reductase  41.35 
 
 
218 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0887  NADPH-dependent FMN reductase  42.44 
 
 
202 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0985  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
202 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1997  NADPH-dependent FMN reductase  38.54 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.88361  normal  0.0341206 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0067  putative oxidoreductase  31.22 
 
 
192 aa  84.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
195 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  32.46 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  29.22 
 
 
180 aa  55.1  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  28.33 
 
 
178 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  28.33 
 
 
178 aa  54.7  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  28.33 
 
 
178 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  31.58 
 
 
179 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
197 aa  54.7  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  31.58 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  31.58 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  31.58 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  28.07 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  27.78 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  27.78 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  29.84 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  34.04 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  28.07 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
197 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  29.61 
 
 
188 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  31.45 
 
 
188 aa  48.5  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  27.87 
 
 
198 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 
195 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 
192 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  35.11 
 
 
190 aa  47.8  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  25.83 
 
 
187 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 
193 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
190 aa  45.1  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  28.26 
 
 
185 aa  44.7  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  27.73 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  30.61 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  26.61 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2733  NADPH-dependent FMN reductase  27.59 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  33.33 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  31.52 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  31.63 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 
303 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 
185 aa  42  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
197 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  29.17 
 
 
180 aa  42.4  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 
193 aa  42  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  25.2 
 
 
202 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2123  NADPH-dependent FMN reductase  25.42 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  26.89 
 
 
186 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 
190 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
181 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  28.41 
 
 
192 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  26.09 
 
 
187 aa  41.6  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  26.89 
 
 
186 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  31.63 
 
 
188 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  30.3 
 
 
191 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>