266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1578 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
192 aa  396  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  74.18 
 
 
187 aa  295  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  65.59 
 
 
197 aa  261  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  66.48 
 
 
186 aa  254  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  60.85 
 
 
190 aa  252  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  61.29 
 
 
191 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  53.23 
 
 
209 aa  214  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  57.92 
 
 
183 aa  214  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  48.24 
 
 
201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  44.16 
 
 
199 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  46.67 
 
 
192 aa  151  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  63.39 
 
 
113 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  41.71 
 
 
188 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  43.72 
 
 
190 aa  141  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  38.5 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  43.65 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  41.05 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
183 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  44.9 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  37.77 
 
 
188 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  42.62 
 
 
197 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  37.23 
 
 
187 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
350 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  44.29 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  37.5 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  38.3 
 
 
190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  36.96 
 
 
188 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  37.63 
 
 
372 aa  124  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  43.52 
 
 
192 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  44.97 
 
 
197 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 
194 aa  117  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  43.16 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  38.04 
 
 
189 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  41.58 
 
 
190 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  38.02 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  36.98 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  38.92 
 
 
193 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  35.98 
 
 
227 aa  105  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  35.83 
 
 
190 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
189 aa  101  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  42.31 
 
 
180 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  36.22 
 
 
188 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  33.86 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 
186 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  35.16 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  35.79 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03840  conserved hypothetical protein  33.74 
 
 
213 aa  93.6  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  34.02 
 
 
230 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  38.39 
 
 
188 aa  92  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  35.45 
 
 
205 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  31.75 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  34.39 
 
 
192 aa  89  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  35.53 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  32.24 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  35.42 
 
 
303 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  36.61 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  39.33 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  39.73 
 
 
219 aa  77.8  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  35.46 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  34.03 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  35.29 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  35.22 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  36.55 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  36.55 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  32.62 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  31.58 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  31.1 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  33.09 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  33.82 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  33.77 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  32.88 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  33.13 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  33.13 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  36.17 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  34.85 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  31.67 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  36.69 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  33.77 
 
 
179 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  33.77 
 
 
178 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
306 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  33.77 
 
 
178 aa  61.6  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  33.77 
 
 
178 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 
184 aa  62  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>