281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5477 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
205 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  53.85 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  48.98 
 
 
193 aa  192  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  47.96 
 
 
190 aa  187  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  48.99 
 
 
194 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  47.42 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  47.45 
 
 
186 aa  168  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  47.12 
 
 
189 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  47.64 
 
 
189 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  46.67 
 
 
202 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  44.83 
 
 
197 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  52.6 
 
 
205 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  41.71 
 
 
203 aa  154  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  45.13 
 
 
214 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  45.88 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  45.21 
 
 
194 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  41.75 
 
 
192 aa  141  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  42.13 
 
 
188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  40.93 
 
 
178 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 
198 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  41.36 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
190 aa  118  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  41.8 
 
 
197 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  39.11 
 
 
187 aa  115  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  39.89 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  39.25 
 
 
190 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  33.51 
 
 
190 aa  112  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  37.31 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  43.84 
 
 
191 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  39.18 
 
 
188 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  35.68 
 
 
192 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  36.36 
 
 
183 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 
195 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  36.13 
 
 
192 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  37.36 
 
 
188 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  37.23 
 
 
190 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  32.45 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  33.5 
 
 
197 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
188 aa  94  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  34.39 
 
 
192 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
183 aa  91.7  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  31.98 
 
 
197 aa  88.2  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  32.24 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  35.18 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  34.2 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  37.06 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  35.35 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  34.85 
 
 
192 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  34.67 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  30.17 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  34.04 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  29.26 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  27.53 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  40.48 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 
350 aa  75.1  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  29.1 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  43.86 
 
 
113 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  30.73 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.71 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  24.64 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  35.1 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  35.1 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  35.1 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  34.21 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  35.33 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2123  NADPH-dependent FMN reductase  31.17 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  29.73 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  33.91 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  31.96 
 
 
184 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  27.17 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  29.27 
 
 
192 aa  62  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 
183 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  31.54 
 
 
188 aa  61.6  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  29.78 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2199  NADPH-dependent FMN reductase  31.06 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  31.46 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  28.46 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  28.46 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  29.24 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  31.43 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2733  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  29.78 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  33.58 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  29.07 
 
 
183 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>