234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0330 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  62.37 
 
 
197 aa  265  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  61.34 
 
 
197 aa  258  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  59.16 
 
 
192 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  47.67 
 
 
199 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  47.62 
 
 
186 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  44.97 
 
 
191 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  42.86 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
190 aa  145  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  40.31 
 
 
190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  39.15 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  42.48 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  43.65 
 
 
192 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  43.08 
 
 
303 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  37.24 
 
 
209 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  37.95 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  37.95 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  38.54 
 
 
183 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  36.82 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  35.9 
 
 
190 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  35.42 
 
 
190 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  37.11 
 
 
201 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  33.51 
 
 
188 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  36.13 
 
 
197 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
194 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  34.24 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  35.15 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  35.6 
 
 
187 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  35.57 
 
 
188 aa  99  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  35.81 
 
 
183 aa  98.6  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 
203 aa  98.2  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  31.84 
 
 
197 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
230 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
195 aa  94.7  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  32.82 
 
 
189 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  32.45 
 
 
187 aa  92.8  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  34.43 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  29.74 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
186 aa  87  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  31.47 
 
 
178 aa  85.1  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  28.04 
 
 
190 aa  84.7  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  30.3 
 
 
227 aa  84.3  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  30.96 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  30.32 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 
192 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  31.11 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  34.51 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 
306 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  40.17 
 
 
113 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  32.18 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  28.5 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  32.28 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  32.24 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  32.81 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  29.23 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  35.33 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  36.24 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  35.21 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  35.57 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  33.53 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  31.44 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  31.44 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  36.69 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  33.1 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  36.62 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  35.61 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  36.62 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  34.51 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  34.85 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  35.07 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  33.79 
 
 
183 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  34.67 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  34.67 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  34.67 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  27.75 
 
 
192 aa  62  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.24 
 
 
185 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  32.28 
 
 
197 aa  61.6  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  37.84 
 
 
186 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  32.12 
 
 
184 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.81 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  32.21 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.81 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.81 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.81 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  38.32 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>