123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1732 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
154 aa  309  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  60.4 
 
 
156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3457  GCN5-related N-acetyltransferase  53.69 
 
 
153 aa  156  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0083  GCN5-related N-acetyltransferase  56.67 
 
 
160 aa  142  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1478  GCN5-related N-acetyltransferase  45.21 
 
 
158 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2969  GCN5-related N-acetyltransferase  46.26 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1491  GCN5-related N-acetyltransferase  45.95 
 
 
160 aa  122  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51524  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1547  GCN5-related N-acetyltransferase  46.62 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2848  GCN5-related N-acetyltransferase  45.03 
 
 
161 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108205  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4387  GCN5-related N-acetyltransferase  45.03 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  39.07 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1243  GCN5-related N-acetyltransferase  39.33 
 
 
153 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0691  GCN5-related N-acetyltransferase  37.09 
 
 
160 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3780  GCN5-related N-acetyltransferase  40.52 
 
 
159 aa  100  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28000  acetyltransferase (GNAT) family protein  35.76 
 
 
175 aa  100  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0943003  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0749  GCN5-related N-acetyltransferase  36.62 
 
 
179 aa  97.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.743361  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3256  tRNA (Guanine37-N1) methyltransferase  42.38 
 
 
385 aa  97.4  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.840049  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0962  GCN5-related N-acetyltransferase  36.77 
 
 
172 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2992  GCN5-related protein N-acetyltransferase  35.76 
 
 
179 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4116  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  36.42 
 
 
338 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  42.97 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  35.48 
 
 
350 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 
372 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0641  protein of unknown function UPF0157  30.38 
 
 
347 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000199394  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1979  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000336011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2224  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
308 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0079583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2728  acetyltransferase  23.38 
 
 
157 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000396262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  32.93 
 
 
364 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1869  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.49 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2377  acetyltransferase, GNAT family  27.97 
 
 
308 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2954  acetyltransferase, GNAT family  27.97 
 
 
312 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878787  hitchhiker  0.00000560426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64320  hypothetical protein  36.21 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161713  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2510  acetyltransferase, GNAT family  27.27 
 
 
308 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1956  acetyltransferase (GNAT) family protein  35.82 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2446  acetyltransferase  26.71 
 
 
308 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.034806  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0900  acetyltransferase  36.17 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0897  acetyltransferase  36.17 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5584  hypothetical protein  35.34 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1739  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2765  acetyltransferase, GNAT family  22.88 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.422083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2475  acetyltransferase  25 
 
 
157 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000339819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2514  acetyltransferase  25 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0902749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2699  acetyltransferase  25 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2713  acetyltransferase, GNAT family  25 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000871829 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3382  acetyltransferase  27.14 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054841  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2278  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
167 aa  51.2  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3357  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.1 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3163  acetyltransferase  26.09 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3057  acetyltransferase  26.09 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000438891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3412  acetyltransferase  26.09 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3382  acetyltransferase, GNAT family  26.09 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2247  acetyltransferase  25.5 
 
 
308 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0012519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3147  acetyltransferase  26.09 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000022061  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2167  acetyltransferase  25.85 
 
 
308 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2440  acetyltransferase  25 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2411  acetyltransferase  25.5 
 
 
308 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2128  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3085  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00716598  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3383  acetyltransferase, GNAT family  25.36 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0909187  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2180  acetyltransferase  24.83 
 
 
308 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000230557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2439  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00658647  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2278  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
166 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2428  acetyltransferase, GNAT family  24.65 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.324939 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2444  GCN5-related N-acetyltransferase  23.38 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00404569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3457  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
112 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3993  GCN5-related N-acetyltransferase  31.47 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0180  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.218409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2718  acetyltransferase, GNAT family  21.64 
 
 
157 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.445128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4090  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2123  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02910  Acetyltransferase  27.61 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1925  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516117  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2870  acetyltransferase  33.09 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1332  GCN5-related N-acetyltransferase  24.11 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2129  GCN5-related N-acetyltransferase  24.65 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0136  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.34 
 
 
172 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1740  GCN5-related N-acetyltransferase  27.1 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609164  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05970  acetyltransferase  30.41 
 
 
174 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.410057  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2975  acetyltransferase  33.64 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  36.49 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  34.12 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1996  acetyltransferase  25 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1973  acetyltransferase  24.68 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3981  ATPase central domain-containing protein  35.94 
 
 
471 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1468  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 
202 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3698  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.69 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2717  acetyltransferase  27.72 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4143  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3210  putative acetyltransferase  35.53 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0187  acetyltransferase  27.69 
 
 
138 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.046026  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1556  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
178 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2631  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
155 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.512633  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>