44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2439 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2439  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00658647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2444  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
156 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00404569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2728  acetyltransferase  35.85 
 
 
157 aa  104  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000396262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2765  acetyltransferase, GNAT family  35.22 
 
 
157 aa  101  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.422083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2713  acetyltransferase, GNAT family  33.96 
 
 
157 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000871829 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2514  acetyltransferase  33.96 
 
 
157 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0902749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2699  acetyltransferase  33.96 
 
 
157 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2475  acetyltransferase  33.96 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000339819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2440  acetyltransferase  33.33 
 
 
157 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2718  acetyltransferase, GNAT family  36.65 
 
 
157 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0641  protein of unknown function UPF0157  30.86 
 
 
347 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000199394  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2510  acetyltransferase, GNAT family  30.94 
 
 
308 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1478  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2446  acetyltransferase  30.82 
 
 
308 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.034806  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2411  acetyltransferase  30.94 
 
 
308 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2247  acetyltransferase  30.94 
 
 
308 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0012519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2591  acetyltransferase, gnat family  42.25 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1243  GCN5-related N-acetyltransferase  29.22 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2428  acetyltransferase, GNAT family  30.22 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.324939 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2180  acetyltransferase  30.22 
 
 
308 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000230557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2167  acetyltransferase  30.94 
 
 
308 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2848  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2224  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
308 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0079583  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1973  acetyltransferase  27.56 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2969  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2377  acetyltransferase, GNAT family  30 
 
 
308 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2954  acetyltransferase, GNAT family  29.5 
 
 
312 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878787  hitchhiker  0.00000560426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0313  hypothetical protein  30.17 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.744593  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0083  GCN5-related N-acetyltransferase  23.26 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 
154 aa  48.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3457  GCN5-related N-acetyltransferase  25.53 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5496  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
186 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334884  normal  0.121728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2328  hypothetical protein  30 
 
 
164 aa  43.9  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12365  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4116  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  25.58 
 
 
338 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  22.79 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804128  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1925  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
153 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516117  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2916  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1387  acetyltransferase  29.55 
 
 
174 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
171 aa  40.8  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3124  GCN5-related N-acetyltransferase  24.34 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06434  hypothetical protein  21.74 
 
 
175 aa  40.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2820  acetyltransferase, gnat family  26.8 
 
 
186 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>