115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0313 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0313  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.744593  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4090  GCN5-related N-acetyltransferase  55.77 
 
 		 162 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4410  GCN5-related N-acetyltransferase  54.49 
 
 		 162 aa  168  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  47.02 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2537  GCN5-related N-acetyltransferase  45.21 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0878  putative acetyltransferase protein  44.52 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2641  GCN5-related N-acetyltransferase  26.49 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2174  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1925  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64320  hypothetical protein  37.11 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1491  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51524  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3275  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.668307 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1105  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2439  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00658647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.207035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6930  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5584  hypothetical protein  35.42 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2510  acetyltransferase, GNAT family  28.7 
 
 		 308 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115896  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1547  GCN5-related N-acetyltransferase  29.92 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  36.71 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.445128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  37.33 
 
 		 372 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2247  acetyltransferase  28.03 
 
 		 308 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0012519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2167  acetyltransferase  28.03 
 
 		 308 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2411  acetyltransferase  28.03 
 
 		 308 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0008  acetyltransferase  28.9 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1739  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2180  acetyltransferase  27.78 
 
 		 308 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000230557  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.94 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3592  GCN5-related N-acetyltransferase  28.42 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.41665 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2428  acetyltransferase, GNAT family  27.27 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.324939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 299 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2388  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1056  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 314 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2224  GCN5-related N-acetyltransferase  27.68 
 
 		 308 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0079583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0083  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2945  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02910  Acetyltransferase  27.21 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2446  acetyltransferase  27.36 
 
 		 308 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.034806  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18031  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.142661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 		 200 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3456  acetyltransferase  29.07 
 
 		 207 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.436369  hitchhiker  6.246790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  32.99 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1502  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.02 
 
 		 318 aa  44.3  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.56 
 
 		 147 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  32.89 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3234  acetyltransferase, GNAT family  26.83 
 
 		 295 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.157565 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.58 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 		 155 aa  43.9  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6022  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000365259  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2055  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000246116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2256  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  45.65 
 
 		 350 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0180  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.218409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2074  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000267739  normal  0.205343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.67 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  32.35 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356632 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2916  GCN5-related N-acetyltransferase  25.44 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.7 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  28.7 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3176  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.7 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.7 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0191  acetyltransferase  26.28 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 308 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  33.03 
 
 		 289 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 		 309 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1890  acetyltransferase  26.74 
 
 		 207 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0234  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.67 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.35 
 
 		 152 aa  42  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3035  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 		 152 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1468  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1928  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2087  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000114873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  25.24 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  28.42 
 
 		 312 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6596  GCN5-related N-acetyltransferase  40.23 
 
 		 286 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0238  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00071184  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1043  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1957  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000038315  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.26 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659195  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6434  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 300 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6365  GCN5-related N-acetyltransferase  32.99 
 
 		 300 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6669  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 300 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  29.06 
 
 		 158 aa  40.8  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2649  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 		 169 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3243  acetyltransferase  29.11 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376416  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1896  acetyltransferase  31.33 
 
 		 295 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04830  putative acetyltransferase  38.46 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0461  putative acetyltransferase  42.5 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>