180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6365 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_6365  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
300 aa  613  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6068  GCN5-related N-acetyltransferase  96.67 
 
 
300 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6434  GCN5-related N-acetyltransferase  80.33 
 
 
300 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6669  GCN5-related N-acetyltransferase  80.33 
 
 
300 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097443  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5516  GCN5-related N-acetyltransferase  67 
 
 
300 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0715522  normal  0.230819 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0771  putative acetyltransferase  56.31 
 
 
294 aa  346  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6093  GCN5-related N-acetyltransferase  55.25 
 
 
294 aa  332  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335222  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1491  hypothetical protein  55.78 
 
 
290 aa  328  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405441  hitchhiker  0.00239117 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6566  GCN5-related N-acetyltransferase  49.65 
 
 
294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225475 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6595  GCN5-related N-acetyltransferase  46.31 
 
 
298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6280  GCN5-related N-acetyltransferase  46.76 
 
 
286 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0285915  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6448  GCN5-related N-acetyltransferase  46.42 
 
 
286 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.863583  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6683  GCN5-related N-acetyltransferase  46.42 
 
 
286 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0785  putative acetyltransferase  44.41 
 
 
296 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6350  GCN5-related N-acetyltransferase  45.73 
 
 
286 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6054  GCN5-related N-acetyltransferase  45.39 
 
 
286 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3079  GCN5-related N-acetyltransferase  39.8 
 
 
287 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0054  GCN5-related N-acetyltransferase  44.71 
 
 
291 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699783  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  41.16 
 
 
287 aa  209  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  44.91 
 
 
292 aa  205  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0245  acetyltransferase, GNAT family  41.75 
 
 
285 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3643  acetyltransferase, GNAT family  41.2 
 
 
285 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  40.99 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2644  GCN5-related N-acetyltransferase  41.96 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3401  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 
285 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217688  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0160  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 
285 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1337  GCN5-related N-acetyltransferase  40.99 
 
 
282 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.385817  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2937  GCN5-related N-acetyltransferase  40.21 
 
 
285 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2344  GCN5-related N-acetyltransferase  38.74 
 
 
293 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  41.7 
 
 
278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835638 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5669  hypothetical protein  38.64 
 
 
281 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5030  GCN5-related N-acetyltransferase  38.83 
 
 
300 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 
277 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5009  GCN5-related N-acetyltransferase  39.93 
 
 
278 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.469699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 
322 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1919  hypothetical protein  40.77 
 
 
275 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2911  GCN5-related N-acetyltransferase  39.02 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4965  GCN5-related N-acetyltransferase  38.21 
 
 
277 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.048465 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5606  GCN5-related N-acetyltransferase  35.31 
 
 
296 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854506  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1915  hypothetical protein  37.05 
 
 
309 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4954  putative acetyltransferase protein  35.89 
 
 
292 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5858  acetyltransferase  34.15 
 
 
312 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3078  GCN5-related N-acetyltransferase  30.8 
 
 
292 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.047588 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4426  GCN5-related N-acetyltransferase  33.2 
 
 
291 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5909  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
273 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05191  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1687  acetyltransferase, GNAT family  25.94 
 
 
283 aa  99  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3690  acetyltransferase, GNAT family  27.09 
 
 
286 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1475  acetyltransferase  25.94 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1655  acetyltransferase, GNAT family  27.09 
 
 
286 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  33.03 
 
 
283 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.730589  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1760  acetyltransferase, GNAT family  26.69 
 
 
286 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1710  acetyltransferase  26.69 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1465  acetyltransferase  26.69 
 
 
286 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0770  acetyltransferase, GNAT family  27.54 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000560272  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4467  acetyltransferase, GNAT family  27.54 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0564586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1503  acetyltransferase  24.81 
 
 
286 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1619  acetyltransferase  24.81 
 
 
286 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1248  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2723  GCN5-related N-acetyltransferase  30.74 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531068  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  25.84 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.205056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  23.48 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4083  acetyltransferase  27.35 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000292268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9240  acetyltransferase protein  30.15 
 
 
279 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4429  acetyltransferase  26.27 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4428  acetyltransferase, GNAT family  28.99 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4245  acetyltransferase  26.92 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0591633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4576  acetyltransferase  26.92 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4094  acetyltransferase  26.92 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0682  GCN5-related N-acetyltransferase  32.11 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.341989  normal  0.410017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0576  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0543356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4480  acetyltransferase, GNAT family  27.14 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5651  GCN5-related N-acetyltransferase  28.94 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185637  normal  0.820471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5735  hypothetical protein  29.49 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162476  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  27.39 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0789619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884459 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2798  acetyltransferase  34.27 
 
 
267 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.097578  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1744  acetyltransferase  29.13 
 
 
282 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0310807  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3091  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885505  normal  0.0588943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2084  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1210  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.34789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
282 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3548  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 
399 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1972  GCN5-related N-acetyltransferase  29.44 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  28.35 
 
 
293 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2134  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
267 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000159892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1800  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00968802  normal  0.0222473 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3639  hypothetical protein  30.32 
 
 
264 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.934549  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2112  putative acetyltransferase  23.55 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3180  GCN5-related N-acetyltransferase  29.3 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3464  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3343  acetyltransferase  25 
 
 
286 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125163  hitchhiker  0.00516187 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1561  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.21 
 
 
291 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381847  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4378  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0423  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1230  hypothetical protein  23.88 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.157123  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7781  GCN5-related N-acetyltransferase  24.05 
 
 
285 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.398474  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1481  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.782256  normal  0.294011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1699  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
144 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0145  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
285 aa  49.7  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345962  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3914  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
281 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>