88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5606 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5606  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
296 aa  605  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854506  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5030  GCN5-related N-acetyltransferase  53.82 
 
 
300 aa  308  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1915  hypothetical protein  55.15 
 
 
309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  53.06 
 
 
322 aa  278  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138829  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5858  acetyltransferase  48.68 
 
 
312 aa  268  8e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3078  GCN5-related N-acetyltransferase  43 
 
 
292 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.047588 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4426  GCN5-related N-acetyltransferase  46.21 
 
 
291 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4954  putative acetyltransferase protein  43.49 
 
 
292 aa  232  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6566  GCN5-related N-acetyltransferase  37.55 
 
 
294 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1491  hypothetical protein  39.53 
 
 
290 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405441  hitchhiker  0.00239117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3079  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 
287 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6093  GCN5-related N-acetyltransferase  37.55 
 
 
294 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335222  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6365  GCN5-related N-acetyltransferase  35.31 
 
 
300 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0245  acetyltransferase, GNAT family  36.46 
 
 
285 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5516  GCN5-related N-acetyltransferase  34.26 
 
 
300 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0715522  normal  0.230819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0160  GCN5-related N-acetyltransferase  36.86 
 
 
285 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0771  putative acetyltransferase  36.22 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6068  GCN5-related N-acetyltransferase  35.07 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6434  GCN5-related N-acetyltransferase  36.24 
 
 
300 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6669  GCN5-related N-acetyltransferase  36.24 
 
 
300 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097443  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6054  GCN5-related N-acetyltransferase  36.03 
 
 
286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6350  GCN5-related N-acetyltransferase  36.4 
 
 
286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6280  GCN5-related N-acetyltransferase  35.64 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0285915  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6448  GCN5-related N-acetyltransferase  35.64 
 
 
286 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.863583  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6683  GCN5-related N-acetyltransferase  35.64 
 
 
286 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6595  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
298 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5669  hypothetical protein  36.63 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  36.53 
 
 
278 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835638 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5009  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
278 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.469699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2911  GCN5-related N-acetyltransferase  39.56 
 
 
280 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0054  GCN5-related N-acetyltransferase  36.13 
 
 
291 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699783  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
277 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1337  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
282 aa  122  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.385817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1919  hypothetical protein  37.74 
 
 
275 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2937  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3643  acetyltransferase, GNAT family  32.87 
 
 
285 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3401  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217688  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0785  putative acetyltransferase  32.81 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2644  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 
282 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2344  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
293 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  34.41 
 
 
297 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4965  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
277 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.048465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4467  acetyltransferase, GNAT family  27.09 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0564586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4245  acetyltransferase  26.29 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0591633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4576  acetyltransferase  26.29 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4083  acetyltransferase  26.29 
 
 
277 aa  92.4  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000292268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0770  acetyltransferase, GNAT family  26.4 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000560272  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4094  acetyltransferase  26.29 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4428  acetyltransferase, GNAT family  26.25 
 
 
231 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4429  acetyltransferase  29.26 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  25.2 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1465  acetyltransferase  23.71 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1687  acetyltransferase, GNAT family  23.37 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3690  acetyltransferase, GNAT family  22.49 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1475  acetyltransferase  23.75 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4480  acetyltransferase, GNAT family  25.2 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1655  acetyltransferase, GNAT family  24.74 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1619  acetyltransferase  23.02 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1503  acetyltransferase  23.02 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1760  acetyltransferase, GNAT family  23.45 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1710  acetyltransferase  24.18 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5909  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05191  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  25.31 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.205056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9240  acetyltransferase protein  25.94 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2115  hypothetical protein  25.44 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.336635  normal  0.573893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  22.84 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1972  GCN5-related N-acetyltransferase  26.36 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3273  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
286 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3343  acetyltransferase  20.59 
 
 
286 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125163  hitchhiker  0.00516187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2723  GCN5-related N-acetyltransferase  24.51 
 
 
281 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531068  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1232  GCN5-related N-acetyltransferase  22.28 
 
 
280 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3091  GCN5-related N-acetyltransferase  21.8 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885505  normal  0.0588943 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2270  GCN5-related N-acetyltransferase  25.65 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6203  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551087  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5651  GCN5-related N-acetyltransferase  24.67 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185637  normal  0.820471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1203  GCN5-related N-acetyltransferase  21.76 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  22.56 
 
 
308 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0789619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3180  GCN5-related N-acetyltransferase  26.39 
 
 
301 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1744  acetyltransferase  25.42 
 
 
282 aa  46.2  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0310807  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2084  GCN5-related N-acetyltransferase  25.25 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  22.9 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2388  GCN5-related N-acetyltransferase  23.39 
 
 
280 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5735  hypothetical protein  24.39 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162476  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  23.61 
 
 
282 aa  42.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4378  GCN5-related N-acetyltransferase  22.73 
 
 
263 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1248  GCN5-related N-acetyltransferase  27.73 
 
 
263 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>