111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5597 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
278 aa  554  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835638 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5009  GCN5-related N-acetyltransferase  71.94 
 
 
278 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.469699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  71.58 
 
 
277 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5669  hypothetical protein  54.96 
 
 
281 aa  289  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1919  hypothetical protein  56.73 
 
 
275 aa  279  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2911  GCN5-related N-acetyltransferase  57.5 
 
 
280 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4965  GCN5-related N-acetyltransferase  50.55 
 
 
277 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.048465 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5516  GCN5-related N-acetyltransferase  40.96 
 
 
300 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0715522  normal  0.230819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0054  GCN5-related N-acetyltransferase  39.11 
 
 
291 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699783  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2937  GCN5-related N-acetyltransferase  40.71 
 
 
285 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6365  GCN5-related N-acetyltransferase  41.7 
 
 
300 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1337  GCN5-related N-acetyltransferase  37.87 
 
 
282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.385817  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6434  GCN5-related N-acetyltransferase  40.08 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6669  GCN5-related N-acetyltransferase  40.08 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097443  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6068  GCN5-related N-acetyltransferase  41.3 
 
 
300 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6280  GCN5-related N-acetyltransferase  39.93 
 
 
286 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0285915  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6350  GCN5-related N-acetyltransferase  38.91 
 
 
286 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6093  GCN5-related N-acetyltransferase  38.02 
 
 
294 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335222  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6448  GCN5-related N-acetyltransferase  39.55 
 
 
286 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.863583  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6683  GCN5-related N-acetyltransferase  39.55 
 
 
286 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3079  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
287 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6054  GCN5-related N-acetyltransferase  38.91 
 
 
286 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6566  GCN5-related N-acetyltransferase  37.05 
 
 
294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225475 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0771  putative acetyltransferase  38.59 
 
 
294 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1491  hypothetical protein  37.64 
 
 
290 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405441  hitchhiker  0.00239117 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2644  GCN5-related N-acetyltransferase  38.4 
 
 
282 aa  152  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2344  GCN5-related N-acetyltransferase  38.43 
 
 
293 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  38.66 
 
 
287 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3078  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
292 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.047588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  37.02 
 
 
297 aa  145  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5030  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 
300 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0245  acetyltransferase, GNAT family  34.59 
 
 
285 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3643  acetyltransferase, GNAT family  37.36 
 
 
285 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4426  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
291 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0160  GCN5-related N-acetyltransferase  33.46 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6595  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3401  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217688  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0785  putative acetyltransferase  34.16 
 
 
296 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138829  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5858  acetyltransferase  36.04 
 
 
312 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5606  GCN5-related N-acetyltransferase  36.53 
 
 
296 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854506  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4954  putative acetyltransferase protein  35.61 
 
 
292 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1915  hypothetical protein  38.96 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  35.15 
 
 
283 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.730589  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1248  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5909  GCN5-related N-acetyltransferase  33.47 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05191  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4467  acetyltransferase, GNAT family  24.7 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0564586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0770  acetyltransferase, GNAT family  25.23 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000560272  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1710  acetyltransferase  28.3 
 
 
286 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3690  acetyltransferase, GNAT family  28.88 
 
 
286 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1760  acetyltransferase, GNAT family  28.3 
 
 
286 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1655  acetyltransferase, GNAT family  28.1 
 
 
286 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1465  acetyltransferase  26.62 
 
 
286 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1503  acetyltransferase  27.11 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1619  acetyltransferase  27.11 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0576  GCN5-related N-acetyltransferase  33.48 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0543356 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1475  acetyltransferase  28 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1687  acetyltransferase, GNAT family  27.94 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4429  acetyltransferase  24.68 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4083  acetyltransferase  24.35 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000292268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4428  acetyltransferase, GNAT family  25.99 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4094  acetyltransferase  23.99 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9240  acetyltransferase protein  28.46 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4245  acetyltransferase  24.22 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0591633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4576  acetyltransferase  24.22 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2112  putative acetyltransferase  32.95 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2798  acetyltransferase  32.2 
 
 
267 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.097578  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1230  hypothetical protein  26.03 
 
 
281 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.157123  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  24.88 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.205056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0682  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
269 aa  63.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.341989  normal  0.410017 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2270  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 
281 aa  62.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1210  GCN5-related N-acetyltransferase  28.62 
 
 
269 aa  62.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.34789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0423  GCN5-related N-acetyltransferase  27.57 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4480  acetyltransferase, GNAT family  22.13 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  27.96 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0789619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1744  acetyltransferase  27.27 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0310807  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3091  GCN5-related N-acetyltransferase  25.87 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885505  normal  0.0588943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  26.75 
 
 
282 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  22.17 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3273  GCN5-related N-acetyltransferase  35.12 
 
 
286 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3464  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1972  GCN5-related N-acetyltransferase  28.78 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5735  hypothetical protein  29.51 
 
 
290 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162476  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 
282 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5651  GCN5-related N-acetyltransferase  23.63 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185637  normal  0.820471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3914  GCN5-related N-acetyltransferase  26.82 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2388  GCN5-related N-acetyltransferase  25.91 
 
 
280 aa  49.7  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2084  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1606  hypothetical protein  21.13 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1203  GCN5-related N-acetyltransferase  21.82 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1481  GCN5-related N-acetyltransferase  26.4 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.782256  normal  0.294011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1232  GCN5-related N-acetyltransferase  22.27 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1390  hypothetical protein  21.05 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0145  GCN5-related N-acetyltransferase  25.71 
 
 
285 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345962  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2723  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531068  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0131  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
151 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6203  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
290 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551087  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4371  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>