148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6350 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_6350  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
286 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6054  GCN5-related N-acetyltransferase  97.2 
 
 
286 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6448  GCN5-related N-acetyltransferase  92.31 
 
 
286 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.863583  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6683  GCN5-related N-acetyltransferase  92.31 
 
 
286 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6280  GCN5-related N-acetyltransferase  91.61 
 
 
286 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0285915  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1491  hypothetical protein  65.28 
 
 
290 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405441  hitchhiker  0.00239117 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6595  GCN5-related N-acetyltransferase  63.54 
 
 
298 aa  371  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6093  GCN5-related N-acetyltransferase  64.69 
 
 
294 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335222  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6566  GCN5-related N-acetyltransferase  58.72 
 
 
294 aa  319  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225475 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0771  putative acetyltransferase  53.58 
 
 
294 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0785  putative acetyltransferase  51.86 
 
 
296 aa  292  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5516  GCN5-related N-acetyltransferase  50.52 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0715522  normal  0.230819 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6365  GCN5-related N-acetyltransferase  45.73 
 
 
300 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6068  GCN5-related N-acetyltransferase  46.48 
 
 
300 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6434  GCN5-related N-acetyltransferase  45.05 
 
 
300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6669  GCN5-related N-acetyltransferase  45.05 
 
 
300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097443  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0054  GCN5-related N-acetyltransferase  49.25 
 
 
291 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699783  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2937  GCN5-related N-acetyltransferase  48.01 
 
 
285 aa  248  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3079  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  45.49 
 
 
297 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  46.26 
 
 
292 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  45.3 
 
 
287 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3401  GCN5-related N-acetyltransferase  43.46 
 
 
285 aa  214  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217688  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3643  acetyltransferase, GNAT family  44.93 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0160  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0245  acetyltransferase, GNAT family  40.58 
 
 
285 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2344  GCN5-related N-acetyltransferase  42.4 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4954  putative acetyltransferase protein  38.75 
 
 
292 aa  178  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2644  GCN5-related N-acetyltransferase  39.93 
 
 
282 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3078  GCN5-related N-acetyltransferase  36.2 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.047588 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 
277 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1337  GCN5-related N-acetyltransferase  39.15 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.385817  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5030  GCN5-related N-acetyltransferase  38.38 
 
 
300 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  40.54 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138829  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  38.91 
 
 
278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835638 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5009  GCN5-related N-acetyltransferase  38.69 
 
 
278 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.469699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1919  hypothetical protein  38.71 
 
 
275 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5669  hypothetical protein  35.77 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2911  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 
280 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4965  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
277 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.048465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1915  hypothetical protein  37.55 
 
 
309 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5858  acetyltransferase  38.35 
 
 
312 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5606  GCN5-related N-acetyltransferase  36.4 
 
 
296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854506  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4426  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
291 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5909  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05191  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1465  acetyltransferase  24.06 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1687  acetyltransferase, GNAT family  24.44 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1475  acetyltransferase  24.44 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 
283 aa  86.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.730589  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4467  acetyltransferase, GNAT family  30.8 
 
 
277 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0564586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1760  acetyltransferase, GNAT family  24.06 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1710  acetyltransferase  23.68 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1248  GCN5-related N-acetyltransferase  32.71 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9240  acetyltransferase protein  30.47 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1655  acetyltransferase, GNAT family  24.44 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0770  acetyltransferase, GNAT family  29.91 
 
 
277 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000560272  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1503  acetyltransferase  23.31 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1619  acetyltransferase  23.31 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0576  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0543356 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3690  acetyltransferase, GNAT family  22.76 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2723  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531068  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4428  acetyltransferase, GNAT family  31.07 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4083  acetyltransferase  31.07 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000292268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4094  acetyltransferase  29.94 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4245  acetyltransferase  30.51 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0591633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4576  acetyltransferase  30.51 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4429  acetyltransferase  28.16 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5651  GCN5-related N-acetyltransferase  30.24 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185637  normal  0.820471 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.205056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3091  GCN5-related N-acetyltransferase  28.98 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885505  normal  0.0588943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0682  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.341989  normal  0.410017 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5735  hypothetical protein  30.38 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162476  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3639  hypothetical protein  33.48 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.934549  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4480  acetyltransferase, GNAT family  27.93 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3464  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
276 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7781  GCN5-related N-acetyltransferase  25.72 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.398474  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1972  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
286 aa  56.6  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  25.18 
 
 
308 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0789619 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1561  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.73 
 
 
291 aa  55.8  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381847  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3343  acetyltransferase  25.24 
 
 
286 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125163  hitchhiker  0.00516187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2798  acetyltransferase  28.16 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.097578  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0145  GCN5-related N-acetyltransferase  27.11 
 
 
285 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345962  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3271  GCN5-related N-acetyltransferase  23.62 
 
 
292 aa  52.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2084  GCN5-related N-acetyltransferase  26.79 
 
 
267 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1816  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
293 aa  52.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0940  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
161 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3243  acetyltransferase  39.53 
 
 
169 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376416  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3180  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1210  GCN5-related N-acetyltransferase  27.1 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.34789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0675  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1744  acetyltransferase  26.21 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0310807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2112  putative acetyltransferase  25.36 
 
 
280 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24790  N-acetyltransferase  28.57 
 
 
284 aa  48.9  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.37 
 
 
162 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1348  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
141 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.4 
 
 
181 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
141 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171947  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>