264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0131 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0131  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  55 
 
 
147 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  55 
 
 
147 aa  168  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0223271  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3547  GCN5-related N-acetyltransferase  52.78 
 
 
147 aa  167  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.271808  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  54.29 
 
 
147 aa  166  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0169  GCN5-related N-acetyltransferase  53.47 
 
 
147 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4085  GCN5-related N-acetyltransferase  52.08 
 
 
147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0192  acetyltransferase  53.24 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  51.05 
 
 
153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0173  GCN5-related N-acetyltransferase  51.39 
 
 
147 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  49.31 
 
 
147 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0158  GCN5-related N-acetyltransferase  51.7 
 
 
153 aa  153  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0227912  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4344  GCN5-related N-acetyltransferase  51.05 
 
 
148 aa  150  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.333923  normal  0.255888 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05581  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  48.63 
 
 
144 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0185  putative acetyltransferase  47.22 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001601  acetyltransferase  49.32 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1418  putative acetyltransferase  39.04 
 
 
148 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.217428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6896  GCN5-related N-acetyltransferase  40.79 
 
 
172 aa  92  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394288  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.46 
 
 
163 aa  67  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1322  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.2 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.53 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.126445  normal  0.618144 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0227  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.2 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.33 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.56 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.8 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.469186  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2124  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.06 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2087  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.06 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.279688  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0145  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.78 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0799  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.67 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.18 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  28.77 
 
 
373 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2014  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.3 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00106333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1147  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.03 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547985  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0149  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.76 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182937  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2475  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.45 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3934  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  35.43 
 
 
308 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  36.72 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4042  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.94 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.53 
 
 
181 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1941  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2153  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.71 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, putative  22.54 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0811  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  35.07 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.823306  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1771  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.46 
 
 
173 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1650  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000764715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.17 
 
 
161 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.57 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351155  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.84 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.07 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0563  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4642  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.589494  normal  0.952102 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0029  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.92 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1178  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.92 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.165721 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2886  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.24 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.81 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.51 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.82 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0043  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, RimI-like protein  37.37 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2212  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.77 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.77 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.77 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1757  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.31 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.77 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2472  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.97 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  0.87758 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.77 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1975  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
205 aa  48.5  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0587  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.17 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  30.77 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0025  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.13 
 
 
176 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0146128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.77 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.77 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2697  acetyltransferase, GNAT family  28.89 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0628  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.54 
 
 
195 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0615  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.85 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0936  GCN5-related N-acetyltransferase  38.16 
 
 
149 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.256196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4456  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.36 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0455  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.76 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6822  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  35.71 
 
 
297 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
381 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4787  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
278 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835638 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2712  spermine/spermidine acetyltransferase  30.61 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0316  ribosomal protein-alanine-acetyltransferase  26.24 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0238467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1843  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  41.03 
 
 
164 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00686227  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6006  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.04 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.132582 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01360  acetyltransferase, GNAT family family (AFU_orthologue; AFUA_1G09260)  28.48 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  31.62 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.53 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129008  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
368 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.36 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0294  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.69 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000661425  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1068  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.35 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.6 
 
 
371 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1177  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0246629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  32.99 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2362  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.34 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0292  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.06 
 
 
171 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00273276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3396  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>