89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4954 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4954  putative acetyltransferase protein  100 
 
 
292 aa  593  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  48.48 
 
 
322 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138829  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3078  GCN5-related N-acetyltransferase  45.76 
 
 
292 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.047588 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5030  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 
300 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5606  GCN5-related N-acetyltransferase  43.49 
 
 
296 aa  232  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854506  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4426  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
291 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5858  acetyltransferase  43.91 
 
 
312 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1915  hypothetical protein  41.78 
 
 
309 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6054  GCN5-related N-acetyltransferase  39.79 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6683  GCN5-related N-acetyltransferase  39.79 
 
 
286 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6448  GCN5-related N-acetyltransferase  39.79 
 
 
286 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.863583  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6350  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
286 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3079  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
287 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6280  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 
286 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0285915  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5516  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 
300 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0715522  normal  0.230819 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6566  GCN5-related N-acetyltransferase  38.08 
 
 
294 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0054  GCN5-related N-acetyltransferase  36.33 
 
 
291 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699783  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1491  hypothetical protein  38.65 
 
 
290 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405441  hitchhiker  0.00239117 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  36.79 
 
 
287 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6093  GCN5-related N-acetyltransferase  39.47 
 
 
294 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335222  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6595  GCN5-related N-acetyltransferase  37.05 
 
 
298 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2937  GCN5-related N-acetyltransferase  36.71 
 
 
285 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0771  putative acetyltransferase  36.17 
 
 
294 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  35.64 
 
 
297 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  36.3 
 
 
292 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6068  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
300 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6365  GCN5-related N-acetyltransferase  35.89 
 
 
300 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6669  GCN5-related N-acetyltransferase  35.86 
 
 
300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097443  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6434  GCN5-related N-acetyltransferase  35.86 
 
 
300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2344  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5669  hypothetical protein  36.09 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4965  GCN5-related N-acetyltransferase  37.92 
 
 
277 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.048465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2911  GCN5-related N-acetyltransferase  40.53 
 
 
280 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  35.98 
 
 
277 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0785  putative acetyltransferase  33.33 
 
 
296 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1919  hypothetical protein  39.39 
 
 
275 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  35.61 
 
 
278 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835638 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5009  GCN5-related N-acetyltransferase  38.49 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.469699 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2644  GCN5-related N-acetyltransferase  36.43 
 
 
282 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0160  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0245  acetyltransferase, GNAT family  34.66 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3401  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217688  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1337  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 
282 aa  115  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.385817  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3643  acetyltransferase, GNAT family  35.21 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5909  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05191  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3690  acetyltransferase, GNAT family  25.56 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1248  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
263 aa  89.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1465  acetyltransferase  22.86 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1687  acetyltransferase, GNAT family  22.86 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1475  acetyltransferase  22.86 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1655  acetyltransferase, GNAT family  24.06 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1710  acetyltransferase  22.93 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0770  acetyltransferase, GNAT family  27.16 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000560272  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1619  acetyltransferase  22.5 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1503  acetyltransferase  22.5 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4467  acetyltransferase, GNAT family  26.33 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0564586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1760  acetyltransferase, GNAT family  23.68 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4576  acetyltransferase  27.16 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4083  acetyltransferase  27.16 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000292268  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4245  acetyltransferase  27.16 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0591633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4094  acetyltransferase  26.75 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.205056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4428  acetyltransferase, GNAT family  27.71 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2723  GCN5-related N-acetyltransferase  28.52 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531068  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.730589  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9240  acetyltransferase protein  28.41 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4429  acetyltransferase  26.27 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4480  acetyltransferase, GNAT family  26.05 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0789619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  31.03 
 
 
2376 aa  59.3  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  23.15 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2355  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2270  GCN5-related N-acetyltransferase  27.19 
 
 
281 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6596  GCN5-related N-acetyltransferase  26.48 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5735  hypothetical protein  24.16 
 
 
290 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162476  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  24.87 
 
 
282 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884459 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2112  putative acetyltransferase  25.97 
 
 
280 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  28.74 
 
 
2374 aa  49.3  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24790  N-acetyltransferase  24 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417683  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0576  GCN5-related N-acetyltransferase  26.49 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0543356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
272 aa  45.8  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5651  GCN5-related N-acetyltransferase  23.21 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185637  normal  0.820471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6203  GCN5-related N-acetyltransferase  24.64 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551087  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1898  hypothetical protein  26.47 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516328  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1606  hypothetical protein  23.13 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0145  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
285 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1972  GCN5-related N-acetyltransferase  24.91 
 
 
286 aa  42.7  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1816  GCN5-related N-acetyltransferase  26.38 
 
 
293 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>