133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3243 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3243  acetyltransferase  100 
 
 
169 aa  341  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376416  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2518  GCN5-related N-acetyltransferase  91.62 
 
 
167 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2649  GCN5-related N-acetyltransferase  86.31 
 
 
169 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2850  GCN5-related N-acetyltransferase  47.88 
 
 
175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35200  putative acetyltransferase  47.27 
 
 
171 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2969  putative acetyltransferase  47.27 
 
 
171 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1017  GCN5-related N-acetyltransferase  43.48 
 
 
172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.879124 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0516  GCN5-related N-acetyltransferase  44.85 
 
 
170 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2664  GCN5-related N-acetyltransferase  44.57 
 
 
192 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.967837  normal  0.139051 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1561  Fis family transcriptional regulator  42.51 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3598  GCN5-related N-acetyltransferase  40.51 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4769  GCN5-related N-acetyltransferase  40.51 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.511421 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5514  GCN5-related N-acetyltransferase  40.51 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542593  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0946  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
175 aa  90.9  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4151  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4676  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
158 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499819  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3731  GCN5-related N-acetyltransferase  35.98 
 
 
178 aa  84.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.546651  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3891  GCN5-related N-acetyltransferase  38.24 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395185  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5140  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358356  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2136  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122562  normal  0.91732 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0496  GCN5-related N-acetyltransferase  33.13 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0101337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2379  acetyltransferase  37.7 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3464  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1357  acetyltransferase  40.31 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2473  acetyltransferase  40.31 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200153  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0341  acetyltransferase  40.31 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0620  acetyltransferase  40.31 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.882351  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0950  acetyltransferase  40.31 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1282  acetyltransferase  40.31 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0773193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1209  acetyltransferase  40.31 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4807  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370573  normal  0.130595 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1524  acetyltransferase  37.98 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2019  putative acetyltransferase  30.41 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.380338  normal  0.0216614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3507  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161188  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0801  acetyltransferase  40.2 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.587739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000447791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2844  GCN5-related N-acetyltransferase  33.76 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5097  GCN5-related N-acetyltransferase  32.7 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5806  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.986614  normal  0.529304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0661  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.6 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1774  hypothetical protein  42.68 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6350  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
286 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6054  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
286 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.97 
 
 
152 aa  48.5  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4109  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
299 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  19.85 
 
 
148 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03825  GNAT family acetyltransferase Nat4, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08210)  21.92 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  39.74 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6448  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 
286 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.863583  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6683  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 
286 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1138  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6280  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 
286 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0285915  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.81 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  25.81 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.72 
 
 
181 aa  45.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4646  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.0465376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.81 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.81 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4083  GCN5-related N-acetyltransferase  32.11 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.284759  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.06 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0756  GCN5-related N-acetyltransferase  34.95 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376269  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  29.41 
 
 
2376 aa  44.7  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1693  GCN5-related N-acetyltransferase  41.25 
 
 
139 aa  44.7  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
180 aa  44.3  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 
161 aa  44.3  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.12 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2388  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557718  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1473  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211829  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.14 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1266  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0793  putative acetyltransferase  26.83 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.294913  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0921  putative acetyltransferase  26.83 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.335602  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1899  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0856381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1756  FR47 domain protein  28.57 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.81 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0234  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  24.73 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0563  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.11 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5403  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120142  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.73 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0246  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.73 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1480  acetyltransferase  24.18 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1453  acetyltransferase  24.18 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7229  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0260  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.73 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.696152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1597  acetyltransferase  24.18 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.23 
 
 
310 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1667  acetyltransferase, GNAT family  24.18 
 
 
155 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2151  putative acetyltransferase  31.25 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2063  acetyltransferase  36.56 
 
 
191 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475157  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1092  acetyltransferase  36.56 
 
 
191 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3240  acetyltransferase  36.56 
 
 
191 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3125  acetyltransferase  36.56 
 
 
191 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>