199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4716 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
153 aa  320  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0158  GCN5-related N-acetyltransferase  67.33 
 
 
153 aa  224  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0227912  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4344  GCN5-related N-acetyltransferase  55.03 
 
 
148 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.333923  normal  0.255888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0131  GCN5-related N-acetyltransferase  51.05 
 
 
151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  51.47 
 
 
147 aa  153  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0223271  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  50.74 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
147 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3547  GCN5-related N-acetyltransferase  50.72 
 
 
147 aa  148  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.271808  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0192  acetyltransferase  49.26 
 
 
147 aa  147  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4085  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
147 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0173  GCN5-related N-acetyltransferase  49.64 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0169  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  45.32 
 
 
147 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05581  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  45.21 
 
 
144 aa  126  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0185  putative acetyltransferase  44.83 
 
 
145 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001601  acetyltransferase  43.26 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1418  putative acetyltransferase  42.25 
 
 
148 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.217428  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1941  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6896  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
172 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394288  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  33.56 
 
 
373 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0757  hypothetical protein  29.05 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.365522  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.06 
 
 
371 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0799  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.77 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4787  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
185 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.62 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.469186  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.68 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.126445  normal  0.618144 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1322  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.68 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
382 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  33.08 
 
 
367 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2475  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.51 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05130  ard1 family protein, putative  32.23 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0227  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25.68 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.54 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.51 
 
 
179 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1715  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.23 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.61 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4456  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
150 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0903  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 
173 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1147  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.2 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547985  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2153  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.03 
 
 
176 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
368 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.63 
 
 
181 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1757  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.29 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  29.1 
 
 
364 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.33 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0328  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  26.9 
 
 
189 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003254  probable acetyltransferase  32 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 
364 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
381 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3243  acetyltransferase  35.71 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376416  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1665  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232999  normal  0.571399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.77 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351155  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6006  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.58 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.132582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 
368 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51345  histone acetyltransferase  26.21 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286975  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003193  hypothetical protein  32.48 
 
 
181 aa  48.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2986  GNAT family acetyltransferase  49.15 
 
 
182 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0136  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.35 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2649  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2518  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1190  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.26 
 
 
181 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25.37 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1292  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.25 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.240965  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0145  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.48 
 
 
166 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  31.78 
 
 
365 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
168 aa  47.4  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  32 
 
 
365 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.22 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2063  acetyltransferase  35.79 
 
 
191 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1456  acetyltransferase  35.79 
 
 
191 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1843  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.61 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00686227  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  26.52 
 
 
158 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1092  acetyltransferase  35.79 
 
 
191 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2899  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.43 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256111  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1372  acetyltransferase  35.79 
 
 
191 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.519651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3240  acetyltransferase  35.79 
 
 
191 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4008  acetyltransferase  35.56 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3125  acetyltransferase  35.79 
 
 
191 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2357  acetyltransferase  35.79 
 
 
191 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01360  acetyltransferase, GNAT family family (AFU_orthologue; AFUA_1G09260)  29.77 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1406  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.93 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.964873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46440  putative acetyltransferase  34.44 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000264759  hitchhiker  0.000775438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2638  putative acetyltransferase  31.07 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4184  acetyltransferase  34.83 
 
 
209 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2087  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.2 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.279688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2124  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.2 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0493  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1332  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4042  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.8 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1068  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.11 
 
 
176 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3713  acetyltransferase, GNAT family  28.85 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.16 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0029  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.69 
 
 
176 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0025  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.48 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0146128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
366 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0292  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.81 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00273276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
185 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1382  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
294 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>