162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4344 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4344  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 148 aa  308  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.333923  normal  0.255888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  55.03 
 
 		 153 aa  187  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0158  GCN5-related N-acetyltransferase  53.02 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0227912  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  55.32 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0223271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  55.32 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  54.61 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0173  GCN5-related N-acetyltransferase  54.55 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0131  GCN5-related N-acetyltransferase  51.05 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3547  GCN5-related N-acetyltransferase  53.15 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.271808  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0169  GCN5-related N-acetyltransferase  53.85 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4085  GCN5-related N-acetyltransferase  53.15 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0192  acetyltransferase  53.19 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  51.75 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0185  putative acetyltransferase  45.52 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05581  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.76 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001601  acetyltransferase  41.38 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1418  putative acetyltransferase  37.86 
 
 		 148 aa  90.1  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.217428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6896  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1322  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.2 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0227  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.2 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  33.1 
 
 		 373 aa  60.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  35.88 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1941  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4042  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.29 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.05 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.469186  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.86 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.126445  normal  0.618144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4787  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 		 381 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0799  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.48 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0145  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.78 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1406  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.65 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.964873  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.12 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.58 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  28.87 
 
 		 369 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.11 
 
 		 371 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0029  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.45 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.56 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.66 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0292  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.29 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00273276 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2145  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.28 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299781  hitchhiker  0.00179484 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2515  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.28 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 		 382 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0757  hypothetical protein  27.78 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.365522  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2153  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.97 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.08 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000164567  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1178  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.89 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.165721 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3585  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.82 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.41 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2475  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.51 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1771  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25.56 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1068  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.27 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  30.37 
 
 		 364 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1147  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547985  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0025  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.97 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0146128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4456  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.37 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0771  putative acetyltransferase  51.85 
 
 		 294 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  27.82 
 
 		 368 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0149  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.17 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182937  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0136  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.06 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003254  probable acetyltransferase  32.43 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.35 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0406  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  24.54 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0043  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, RimI-like protein  35.8 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0667  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.49 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000569259  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1574  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.08 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0903  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1757  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.47 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0316  ribosomal protein-alanine-acetyltransferase  21.28 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0238467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2096  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.35 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2151  putative acetyltransferase  27.7 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.77 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4649  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2697  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 		 152 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 		 396 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.84 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14911  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.69 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3852  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.41 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1665  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232999  normal  0.571399 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.68 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1190  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.64 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2798  acetyltransferase  30.61 
 
 		 267 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.097578  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1292  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.88 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.240965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.71 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.04 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6434  GCN5-related N-acetyltransferase  41.54 
 
 		 300 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1382  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 		 294 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6669  GCN5-related N-acetyltransferase  41.54 
 
 		 300 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1821  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.16 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.477403  normal  0.159791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 		 292 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3272  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2083  acetyltransferase  27.06 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2256  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.35 
 
 		 148 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0642  GCN5-related N-acetyltransferase  41.54 
 
 		 171 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  0.704084 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>