More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4184 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_4184  acetyltransferase  100 
 
 
209 aa  434  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4058  GCN5-related N-acetyltransferase  65.22 
 
 
200 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  62.3 
 
 
185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  63.04 
 
 
185 aa  241  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  54.89 
 
 
186 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  59.66 
 
 
193 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0087  phosphinothricin N-acetyltransferase  60 
 
 
179 aa  198  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0089  phosphinothricin N-acetyltransferase  60 
 
 
179 aa  197  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32151  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0528  GCN5-related N-acetyltransferase  54.02 
 
 
181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  56.73 
 
 
176 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695211  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  54.65 
 
 
180 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6053  GCN5-related N-acetyltransferase  54.39 
 
 
180 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134247  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  52.81 
 
 
205 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104009  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7237  GCN5-related N-acetyltransferase  50.29 
 
 
182 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5346  GCN5-related N-acetyltransferase  48 
 
 
174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0201  GCN5-related N-acetyltransferase  52.91 
 
 
174 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0238  GCN5-related N-acetyltransferase  53.14 
 
 
183 aa  171  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2931  Phosphinothricin acetyltransferase  50 
 
 
178 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
181 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3272  GCN5-related N-acetyltransferase  48.02 
 
 
210 aa  168  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  48.3 
 
 
184 aa  168  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  50.87 
 
 
185 aa  167  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4882  GCN5-related N-acetyltransferase  46.45 
 
 
197 aa  167  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256707  normal  0.880249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3155  GCN5-related N-acetyltransferase  47.7 
 
 
179 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145568  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1154  GCN5-related N-acetyltransferase  50.59 
 
 
186 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0181286  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2530  phosphinothricin N-acetyltransferase  50.59 
 
 
247 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1274  phosphinothricin N-acetyltransferase  50.59 
 
 
247 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1352  phosphinothricin N-acetyltransferase  50.59 
 
 
247 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00885  phosphinothricin N-acetyltransferase  52.84 
 
 
179 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203848  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4517  GCN5-related N-acetyltransferase  48.86 
 
 
187 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.729154  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  50.91 
 
 
182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0556271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  50.91 
 
 
182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  49.72 
 
 
176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1606  GCN5-related N-acetyltransferase  49.4 
 
 
180 aa  164  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0984019  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1301  phosphinothricin N-acetyltransferase  50 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1689  GCN5-related N-acetyltransferase  47.78 
 
 
178 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1014  phosphinothricin N-acetyltransferase  50 
 
 
188 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0284  phosphinothricin N-acetyltransferase  50 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0554  phosphinothricin N-acetyltransferase  50 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450037  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4059  GCN5-related N-acetyltransferase  49.41 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0540643  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1460  GCN5-related N-acetyltransferase  47.75 
 
 
178 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3437  GCN5-related N-acetyltransferase  45.76 
 
 
206 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4023  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
186 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210755  normal  0.806566 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1467  phosphinothricin N-acetyltransferase  48.26 
 
 
188 aa  161  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0385  phosphinothricin acetyltransferase (PPT N-acetyltransferase)  49.14 
 
 
176 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3699  GCN5-related N-acetyltransferase  49.41 
 
 
186 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4669  GCN5-related N-acetyltransferase  49.41 
 
 
186 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.776305  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  48.82 
 
 
186 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.522089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0680  GCN5-related N-acetyltransferase  51.16 
 
 
186 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1472  Phosphinothricin acetyltransferase  48.57 
 
 
174 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3356  GCN5-related N-acetyltransferase  46.86 
 
 
173 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  46.86 
 
 
173 aa  158  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0397  phosphinothricin acetyltransferase protein  50.3 
 
 
183 aa  157  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456114  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  48.5 
 
 
226 aa  157  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3365  GCN5-related N-acetyltransferase  48.24 
 
 
188 aa  157  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00313605  hitchhiker  0.0000000000000200087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1787  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  45.93 
 
 
200 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000010061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1356  GCN5-related N-acetyltransferase  45.4 
 
 
181 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.181273  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5489  GCN5-related N-acetyltransferase  48.24 
 
 
176 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385408  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1103  putative phosphinothricin acetyltransferase  47.09 
 
 
190 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1883  GCN5-related N-acetyltransferase  43.41 
 
 
197 aa  154  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.278862  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3321  phosphinothricin N-acetyltransferase  44.19 
 
 
179 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0173112  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1401  GCN5-related N-acetyltransferase  46.47 
 
 
174 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2733  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 
184 aa  148  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1369  Phosphinothricin acetyltransferase  47.16 
 
 
177 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2866  GCN5-related N-acetyltransferase  44.19 
 
 
195 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0345136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3122  Phosphinothricin acetyltransferase  44.19 
 
 
176 aa  142  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1899  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
167 aa  140  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0856381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0225  GCN5-related N-acetyltransferase  37.85 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5144  Phosphinothricin acetyltransferase  44.64 
 
 
170 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324669  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2342  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
180 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3655  Phosphinothricin acetyltransferase  40.83 
 
 
168 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0929  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 
186 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0523  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
182 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142872  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1500  GCN5-related N-acetyltransferase  39.64 
 
 
184 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4403  GCN5-related N-acetyltransferase  38.42 
 
 
192 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2407  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
195 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0082  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
192 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
186 aa  121  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3131  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  35.63 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3936  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0390446  decreased coverage  0.000407903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3618  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
198 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3378  acetyltransferase  37.28 
 
 
180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0386  Phosphinothricin acetyltransferase  41.38 
 
 
173 aa  118  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3298  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000192346  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  40.99 
 
 
171 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0245  GCN5-related N-acetyltransferase  39.02 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0992  GCN5-related N-acetyltransferase  39.08 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64360  hypothetical protein  40.61 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272704  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1948  sortase related acyltransferase  36.09 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0955  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
204 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  39.63 
 
 
168 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  37.43 
 
 
204 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1335  sortase related acyltransferase  33.93 
 
 
177 aa  112  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000322304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2211  GCN5-related N-acetyltransferase  39.33 
 
 
173 aa  111  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5587  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2038  Phosphinothricin acetyltransferase  39.26 
 
 
175 aa  111  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1813  Phosphinothricin acetyltransferase  37.66 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0287  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>