200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0192 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0192  acetyltransferase  100 
 
 		 147 aa  304  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  83.56 
 
 		 147 aa  254  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0223271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  82.99 
 
 		 147 aa  253  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  81.63 
 
 		 147 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4085  GCN5-related N-acetyltransferase  78.47 
 
 		 147 aa  233  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0169  GCN5-related N-acetyltransferase  77.08 
 
 		 147 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3547  GCN5-related N-acetyltransferase  76.39 
 
 		 147 aa  228  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.271808  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  75 
 
 		 147 aa  227  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0173  GCN5-related N-acetyltransferase  76.39 
 
 		 147 aa  227  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0131  GCN5-related N-acetyltransferase  53.24 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4344  GCN5-related N-acetyltransferase  53.19 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.333923  normal  0.255888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  49.26 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0158  GCN5-related N-acetyltransferase  48.53 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0227912  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001601  acetyltransferase  48.53 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05581  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  46.1 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0185  putative acetyltransferase  43.17 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1418  putative acetyltransferase  43.15 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.217428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6896  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.48 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.97 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1941  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.61 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.82 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.469186  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.46 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1322  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.77 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.77 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.126445  normal  0.618144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4787  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0227  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.77 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1757  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.11 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1178  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.57 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.165721 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2153  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  26.8 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1771  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.67 
 
 		 173 aa  57  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4042  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.75 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.97 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0145  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.41 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2362  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.33 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2475  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.81 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0799  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.73 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  31.97 
 
 		 373 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0136  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.9 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2087  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.19 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.279688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2124  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.19 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1843  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.68 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00686227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4456  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.77 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1406  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.76 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.964873  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3585  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.08 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000164567  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2685  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.47 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.37 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2344  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 293 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.21 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0029  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.75 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0651  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  28.95 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.14 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, putative  26 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1715  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.58 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.99 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1001  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.23 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.491632  hitchhiker  0.0014892 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.61 
 
 		 371 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1944  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.589502  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0025  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.48 
 
 		 176 aa  47  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0146128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.84 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0974186  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0294  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.49 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000661425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2083  acetyltransferase  28.09 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2619  GCN5-related N-acetyltransferase  43.1 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1292  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.08 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.240965  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.47 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0884  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.65 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3429  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  34.21 
 
 		 297 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3183  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.658111  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.52 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.82 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1650  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000764715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2178  acetyltransferase  27.78 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.490627  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4985  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2150  acetyltransferase  36.92 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000318542  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3290  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3222  acetyltransferase  27.78 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.46 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1068  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.57 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2192  acyltransferase  27.78 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.419668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2798  acetyltransferase  34.78 
 
 		 267 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.097578  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1910  acetyltransferase  27.78 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0595926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1899  acyltransferase  27.78 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.627719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2158  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.11 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0157524 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.43 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0757  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.365522  normal  0.529844 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1061  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.17 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288075  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4361  GCN5-related N-acetyltransferase  21.43 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.227098  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0292  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.76 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00273276 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07810  acetyltransferase (GNAT) family protein  35.56 
 
 		 328 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37367  predicted protein  28.47 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0305792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2132  diamine acetyltransferase  29.25 
 
 		 178 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0491515 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.53 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2437  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.53 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>