94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3290 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008043  TM1040_3290  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
193 aa  396  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  49.34 
 
 
185 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.146585  normal  0.318743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1981  GCN5-related N-acetyltransferase  49.34 
 
 
185 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0120  hypothetical protein  50.33 
 
 
164 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.856496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2619  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
161 aa  134  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2685  GCN5-related N-acetyltransferase  44.74 
 
 
166 aa  132  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4956  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
160 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0673  GCN5-related N-acetyltransferase  44.68 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974878  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5800  GCN5-related N-acetyltransferase  42.36 
 
 
280 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.476968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1347  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0183  acetyltransferase  42.25 
 
 
160 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0738  GCN5-related N-acetyltransferase  38.31 
 
 
177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4985  GCN5-related N-acetyltransferase  41.22 
 
 
174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3172  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 
166 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.13673  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2451  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
259 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607994  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03213  acetyltransferase  40.85 
 
 
176 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4255  GCN5-related N-acetyltransferase  35.12 
 
 
181 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.179135  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0749  GCN5-related N-acetyltransferase  40.41 
 
 
255 aa  104  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
167 aa  84.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1452  GCN5-related N-acetyltransferase  37.72 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  36.09 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00567741  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1665  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232999  normal  0.571399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3330  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.26 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421895 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0168  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0894462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4191  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0164  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3491  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4879  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132099  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3082  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
145 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
163 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261026  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5064  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
149 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4390  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
145 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3552  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 
165 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4423  acetyltransferase  25 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5072  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4155  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
149 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.331512 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5788  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.45 
 
 
147 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.45 
 
 
147 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.45 
 
 
147 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  35.45 
 
 
147 aa  55.1  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0675  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
143 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2832  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
153 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0234  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  35.45 
 
 
147 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1650  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000764715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
145 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
141 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.45 
 
 
147 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4463  GCN5-related N-acetyltransferase  24.5 
 
 
145 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0556  hypothetical protein  27.07 
 
 
176 aa  51.6  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.154761  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.35 
 
 
147 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
159 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6390  GCN5-related N-acetyltransferase  25.49 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517471  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0299  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
141 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.336219  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7108  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
157 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.97 
 
 
181 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0225  putative acetyltransferase  28.57 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0238  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.15 
 
 
147 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00071184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3377  GCN5-related N-acetyltransferase  36.71 
 
 
143 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
366 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5431  hypothetical protein  39.19 
 
 
173 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.519598 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0380  acetyltransferase  29.66 
 
 
191 aa  48.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.335252  hitchhiker  0.000000351254 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5257  acetyltransferase  33.33 
 
 
124 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.12 
 
 
150 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3183  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
148 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.658111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0558  putative acetyltransferase  30.34 
 
 
160 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.593494  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0192  acetyltransferase  38.71 
 
 
147 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
147 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0223271  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.24 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
147 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0173  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4085  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
114 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242701  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2187  acetyltransferase  25 
 
 
155 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003254  probable acetyltransferase  30.3 
 
 
113 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
153 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0169  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3547  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.271808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.91 
 
 
152 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
147 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3407  GCN5-related N-acetyltransferase  27.96 
 
 
165 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.204713  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1326  GCN5-related N-acetyltransferase  30.16 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160898  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1757  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.38 
 
 
160 aa  42.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1072  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
132 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4101  acetyltransferase  32.98 
 
 
147 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.945821  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  35.29 
 
 
152 aa  41.2  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0103  hypothetical protein  35.62 
 
 
286 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0117  hypothetical protein  35.62 
 
 
286 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>