48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0148 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
163 aa  334  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261026  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3330  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.03 
 
 
170 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421895 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0164  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0168  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
162 aa  84  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0894462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4191  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
162 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2685  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3552  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3290  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4879  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132099  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  28.05 
 
 
195 aa  60.8  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00567741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
167 aa  60.8  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5257  acetyltransferase  33.66 
 
 
124 aa  60.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3491  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03213  acetyltransferase  26.75 
 
 
176 aa  58.9  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1347  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
177 aa  58.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4255  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
181 aa  57.8  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.179135  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0183  acetyltransferase  31.91 
 
 
160 aa  57.4  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0120  hypothetical protein  30.92 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.856496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0749  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
255 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4956  GCN5-related N-acetyltransferase  25.55 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4423  acetyltransferase  26.03 
 
 
175 aa  54.7  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4390  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
145 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2619  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3172  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
166 aa  54.3  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.13673  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3082  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5800  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
280 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.476968 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5788  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5072  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 
167 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
185 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.146585  normal  0.318743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0738  GCN5-related N-acetyltransferase  29.3 
 
 
177 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2451  GCN5-related N-acetyltransferase  25.16 
 
 
259 aa  51.2  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607994  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0673  GCN5-related N-acetyltransferase  24.32 
 
 
156 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974878  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4985  GCN5-related N-acetyltransferase  24.46 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1981  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0811  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.97 
 
 
147 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.823306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2187  acetyltransferase  35.14 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
141 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5064  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
149 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6390  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517471  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1679  acetyltransferase  30 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00221151  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02191  hypothetical protein  35.14 
 
 
196 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1665  GCN5-related N-acetyltransferase  22.3 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232999  normal  0.571399 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1979  acetyltransferase, GNAT family  30 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.306431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1949  acetyltransferase  30 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0790  putative acetyltransferase  22.15 
 
 
152 aa  40.8  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4155  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
149 aa  40.8  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.331512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>