23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5257 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5257  acetyltransferase  100 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  33.66 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4879  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132099  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4390  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3290  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5072  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5064  GCN5-related N-acetyltransferase  27.38 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5788  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3082  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3330  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.64 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1017  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.879124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03213  acetyltransferase  29.59 
 
 		 176 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2832  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7108  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 		 157 aa  42  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00567741  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0225  putative acetyltransferase  29.73 
 
 		 157 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0164  GCN5-related N-acetyltransferase  22.12 
 
 		 162 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3552  GCN5-related N-acetyltransferase  24.74 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3491  GCN5-related N-acetyltransferase  25.74 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4191  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0749  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 		 255 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0168  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 		 162 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0894462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>