88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3330 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3330  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  100 
 
 		 170 aa  348  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421895 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0164  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  35.03 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4191  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0168  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0894462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 		 167 aa  91.3  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 		 195 aa  85.5  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00567741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3552  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2451  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0183  acetyltransferase  29.63 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3290  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 		 193 aa  77.4  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03213  acetyltransferase  30.77 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4956  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2685  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341972  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4423  acetyltransferase  33.33 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0673  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974878  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1981  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.146585  normal  0.318743 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1347  GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3172  GCN5-related N-acetyltransferase  27.39 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.13673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4985  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4255  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.179135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0749  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5800  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 		 280 aa  60.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0120  hypothetical protein  30.07 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.856496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0738  GCN5-related N-acetyltransferase  27.56 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4879  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132099  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3082  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3491  GCN5-related N-acetyltransferase  24.41 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2619  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4155  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 		 149 aa  50.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.331512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0675  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1776  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.06 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.50288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1364  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.82 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0558  putative acetyltransferase  22.96 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.593494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0380  acetyltransferase  25.58 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.335252  hitchhiker  0.000000351254 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0556  hypothetical protein  24.82 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.154761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4390  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  24.14 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0731728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5431  hypothetical protein  26 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.519598 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1867  ribosomal protein (S18)-alanine acetyltransferase  25.81 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.216572  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5257  acetyltransferase  23.64 
 
 		 124 aa  45.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0413  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.11 
 
 		 153 aa  44.3  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2180  acetyltransferase, GNAT family  32.88 
 
 		 295 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3716  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.37 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0086441  hitchhiker  0.00862742 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.97 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3634  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.89 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3505  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.89 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0838  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.47 
 
 		 103 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1982  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  24.24 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.615427 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03190  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.88 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5064  GCN5-related N-acetyltransferase  27.39 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1896  acetyltransferase  33.33 
 
 		 295 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108924  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0676  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.99 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.895048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1886  acetyltransferase  31.51 
 
 		 295 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.708702  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0240  GCN5-related N-acetyltransferase  23.86 
 
 		 299 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000582767  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  26.39 
 
 		 270 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6269  GCN5-related N-acetyltransferase  23.87 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785089  normal  0.286315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.86 
 
 		 150 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4103  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 		 291 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.17 
 
 		 153 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.4 
 
 		 150 aa  42  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2112  acetyltransferase, GNAT family  28.05 
 
 		 295 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1934  acetyltransferase  28.05 
 
 		 295 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2081  acetyltransferase  28.05 
 
 		 295 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1153  acetyltransferase domain-containing protein  32.14 
 
 		 264 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.17 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0638  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.75 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0103  hypothetical protein  26.53 
 
 		 286 aa  41.2  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0117  hypothetical protein  26.53 
 
 		 286 aa  41.2  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2771  acetyltransferase, GNAT family  27.59 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0074365 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2764  acetyltransferase  27.59 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.824722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0516  GCN5-related N-acetyltransferase  23.36 
 
 		 170 aa  41.2  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2577  acetyltransferase  27.59 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000295975  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1148  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  25.47 
 
 		 188 aa  41.2  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0868  ribosomal-protein-S18-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3809  GCN5-related N-acetyltransferase  38.37 
 
 		 144 aa  41.2  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2475  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.24 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1740  GCN5-related N-acetyltransferase  25.25 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.95 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351155  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2948  streptothricin acetyltransferase  22.86 
 
 		 185 aa  40.8  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  26.51 
 
 		 312 aa  40.8  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1342  acetyltransferase  30.95 
 
 		 264 aa  40.8  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0732306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>