102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3172 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3172  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
166 aa  343  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.13673  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0183  acetyltransferase  50.61 
 
 
160 aa  163  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2685  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0749  GCN5-related N-acetyltransferase  41.94 
 
 
255 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1981  GCN5-related N-acetyltransferase  41.94 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  41.94 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.146585  normal  0.318743 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3290  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 
193 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5800  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
280 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.476968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 
167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1347  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 
177 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2619  GCN5-related N-acetyltransferase  36.48 
 
 
161 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0120  hypothetical protein  39.74 
 
 
164 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.856496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2451  GCN5-related N-acetyltransferase  35.03 
 
 
259 aa  99  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607994  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4255  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.179135  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03213  acetyltransferase  35.67 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0738  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
177 aa  94.4  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4956  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
160 aa  90.9  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0673  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
156 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974878  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4985  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 
174 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1665  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
173 aa  84.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232999  normal  0.571399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1452  GCN5-related N-acetyltransferase  32.74 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4879  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132099  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00567741  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0164  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3330  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.39 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421895 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4191  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0168  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0894462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3491  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3082  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4390  GCN5-related N-acetyltransferase  29.3 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5064  GCN5-related N-acetyltransferase  26.75 
 
 
149 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4463  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3552  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3183  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
148 aa  55.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.658111  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5072  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
145 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5788  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
145 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
163 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261026  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4155  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.331512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4423  acetyltransferase  28.66 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2187  acetyltransferase  32.61 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003254  probable acetyltransferase  29.31 
 
 
113 aa  48.5  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 
147 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  39.44 
 
 
366 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  29.47 
 
 
145 aa  47.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1650  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 
160 aa  47.4  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000764715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0556  hypothetical protein  24.18 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.154761  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0225  putative acetyltransferase  34.92 
 
 
157 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6390  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
151 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517471  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0335  acetyltransferase  30.48 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.793507  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2832  GCN5-related N-acetyltransferase  30.84 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003291  probable acetyltransferase  28.45 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
162 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4101  acetyltransferase  37.84 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.945821  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5431  hypothetical protein  40.98 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.519598 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0246  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.98 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0260  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.98 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.696152  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  27.96 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3377  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.06 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129008  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  49.06 
 
 
202 aa  44.7  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.43 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.98 
 
 
147 aa  44.3  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0234  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.98 
 
 
147 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3674  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
143 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117118  hitchhiker  0.000000840532 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.98 
 
 
147 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.98 
 
 
147 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.98 
 
 
147 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0134  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1001  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.5 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.491632  hitchhiker  0.0014892 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2877  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.51 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.199566  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0938  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.46 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00821471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7108  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2690  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 
216 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.599438  normal  0.339832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1150  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.94 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.372343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1167  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.94 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.508689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1177  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.94 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0246629 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.32 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0319315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  29.47 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.207035  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
162 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0422  acetyltransferase  36.07 
 
 
185 aa  42  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
146 aa  42  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0043  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, RimI-like protein  42.03 
 
 
160 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0884  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.73 
 
 
161 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0091  GCN5-related N-acetyltransferase  22.37 
 
 
164 aa  42  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  26.24 
 
 
167 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313561  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
165 aa  41.6  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0238  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.59 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00071184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.21 
 
 
150 aa  41.6  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.29 
 
 
147 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1048  GCN5-related protein N-acetyltransferase  50.94 
 
 
170 aa  41.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.231564 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1303  GCN5-related N-acetyltransferase  47.17 
 
 
187 aa  41.2  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1160  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.32 
 
 
162 aa  41.2  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0991  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.67 
 
 
150 aa  41.2  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0274305  hitchhiker  0.00000000584057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
241 aa  41.2  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
207 aa  40.8  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.29935  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>